bioperl可以读取fastq文件，对其进行处理，而且一般是双端的序列，可以同时读取两个文件，方法如下：
while ( my $obj1=$fq1->next_seq() and my $obj2=$fq2->next_seq() ) {
my ($id1,$id2)=($obj1->id,$obj2->id);
....
}
这样就可以同时读取read1、read2中的对应序列。
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