iTOL入门：

1. https://www.omicsclass.com/article/417
2. 
   https://www.omicsclass.com/article/778

有些情况下我们需要对进化树的标签进行修改，iTOL可以很好地实现这一功能。如下图所示进化树：

只需要添加一标签的注释文件即可，文件格式如下：

LABELS
#use this template to change the leaf labels, or define/change the internal node names (displayed in mouseover popups)
#lines starting with a hash are comments and ignored during parsing
#=================================================================#
#                    MANDATORY SETTINGS                           #
#=================================================================#
#select the separator which is used to delimit the data below (TAB,SPACE or COMMA).This separator must be used throughout this file (except in the SEPARATOR line, which uses space).
SEPARATOR TAB
#SEPARATOR SPACE
#SEPARATOR COMMA
#Internal tree nodes can be specified using IDs directly, or using the 'last common ancestor' method described in iTOL help pages
#=================================================================#
#       Actual data follows after the "DATA" keyword              #
#=================================================================#
DATA


#NODE_ID,LABEL
#Examples
#defined a name for an internal node
9606|9031Metazoa
#change the label for leaf node 9606
4530     Oryza sativa
45157    Cyanidioschyzon merolae
237895   Cryptosporidium hominis
184922   Giardia lamblia
56636    Aeropyrum pernix
3702     Arabidopsis thaliana
33169    Eremothecium gossypii
222523   Bacillus cereus ATCC 10987
1423     Bacillus subtilis
216816   Bifidobacterium longum
518      Bordetella bronchiseptica
29461    Brucella suis
118099   Buchnera aphidicola APS
6239     Caenorhabditis elegans
155892   Caulobacter crescentus
83560    Chlamydia muridarum
115711   Chlamydia pneumoniae AR39
115713   Chlamydia pneumoniae CWL029
138677   Chlamydia pneumoniae J138

DATA之前的部分都是格式声明，照抄即可。之后就是具体标签修改数据，数据分两列，第一列为原始标签，第二列是修改后的标签，之间以Tab键分隔。准备好数据后就可以加到进化树中了。

刘改后进化树如下：

修改之后可以导出nwk格式：

然后又可以到evolview中编辑：https://www.omicsclass.com/article/671

此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下：

1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程

2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读

3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析

4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘

5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读

6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接：

https://study.omicsclass.com/