基因结构图添加domain信息

基因结构图添加domain信息

在  进化树+基因结构+motif—1张图全显示  这篇文章里讲述了使用TBtools绘制进化树+基因结构+motif图,其中基因结构里展示了CDS、UTR、内含子等的位置信息。这里还可以再加入蛋白质domain的位置信息。

文件准备

domain在蛋白质上的位置信息表。格式如下:

attachments-2018-12-p0pWmwba5c13491090b31.jpg

一行为一个domain的位置信息。

1.第一列为基因ID

2.第二列为domain位于蛋白质上的起始位置

3.第三列为domain位于蛋白质上的终止位置

4.第四列为domain名称

导入数据与设置

如下图所示导入数据。

attachments-2018-12-Q638BcE95c134a766757b.jpg

导入后生成,即可生成图片,TBtools可以自动计算domain在基因上的位置。在基因结构图里会显示出domain的位置信息。

attachments-2018-12-MpjjEpNK5c134b23b16fd.jpg


  • 发表于 2018-12-14 14:24
  • 阅读 ( 6524 )
  • 分类:软件工具

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安生水
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