一键搞定批量序列提取TBtools！
用基因ID提取其序列很简单，ctrl+F找到ID对应的序列，ctrl+C、ctrl+V就好了，少量基因的还OK，但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽？
这里墙裂推荐一个软件，功能很强大，就是TBtoo...
用基因ID提取其序列很简单，ctrl+F找到ID对应的序列，ctrl+C、ctrl+V就好了，少量基因的还OK，但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽？
这里墙裂推荐一个软件，功能很强大，就是TBtools！今天主要讲它批量提取序列的功能(其他功能以后再说，你们也可以自己试试)，这个软件需要在JAVA运行（选中软件，右键打开方式选择java）。
这个软件批量提取序列只需要四步：
1、输入序列文件
输入抽提ID对应序列所在的fasta文件，例如这个物种所有的cds序列的fasta文件。可以直接在下图较长方框内输入fasta文件所在路径和文件名，例如：C:\Users\10792\Desktop\aaa.fasta；或者点击右侧黄色方框输入fasta文件
2、输入ID
ID的格式是每个ID占一行输入ID所在的文件,可以直接在下图方框内输入ID，或者点击右侧黄色方框导入ID文件，注意：输入的ID要和fasta格式">"后面的一致，例如：ID是AT1G51270，fasta如下图才可以将ID对应的序列提取出来。
3、导出结果存放文件
先建一个空的的fasta文件（例如建一个txt文件，将后缀txt改为fasta，就是一个fasta文件了），然后在下图较长方框内输入这个fasta文件所在路径及文件名，例如：C:\Users\10792\Desktop\out.fasta；或者点击右侧黄色方框导入这个结果存放的fasta文件。
4、运行
先点击Initialize初始化处理，待最下面的Start方框变蓝色，点击Start运行。
弹出下图方框就运行完了，速度很快（亲测，拿200多个ID提取序列，只用了不到1秒！！！）。
- 发表于 2018-04-22 19:08
- 阅读 ( 31272 )
- 分类：软件工具
