vcftools随机抽取指定个样品
vcftools随机抽取指定个样品
vcftools可以随机抽取指定个样品的vcf文件，用到的选项为 --max-indv ，指定要从vcf文件中随机抽取指定个样品。
具体用法如下：
下图为原始vcf文件。
随机抽取5个样品，执行以下代码：
vcftools --vcf snp.vcf --max-indv 5 --remove-indels --recode --out outfilename
生成结果文件如下：
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- 发表于 2018-12-29 09:39
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- 分类：软件工具
