以下软件请安装linux版本，安装方法可看软件安装说明，：
hmmsearch： http://hmmer.org/
perl： https://www.perl.org/get.html 记得安装bioperl包
blast ：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download
mcscanX：http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/
java JDK：https://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html
clustalw：http://www.clustal.org/clustal2/
circos：http://circos.ca/software/download/circos/
python：https://www.python.org/
python 版本的mcscan：https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)
meme motif分析：http://meme-suite.org/doc/download.html
samtools ：http://samtools.sourceforge.net/
KaKs_Calculator2.0 ：https://sourceforge.net/projects/kakscalculator2/安装完成之后，记得添加路径到环境变量PATH中，方便使用；
更多可学习：linux系统的使用
1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读
3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析
4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读
5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程
6. 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图
7. 医学相关数据挖掘课程，不用做实验也能发文章：TCGA-差异基因分析、GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化 、GSEA富集分析课程、TCGA临床数据生存分析、TCGA-转录因子分析、TCGA-ceRNA调控网络分析
8.其他，二代测序转录组数据自主分析、NCBI数据上传、二代测序数据解读、
生物信息
698 篇文章
如果觉得我的文章对您有用，请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作！
