甲基化数据中探针位置的分类

甲基化数据中探针位置的分类

从TCGA下载下来的甲基化数据中,最后一列Feature type ,是对甲基化位点的位置分类。主要包括5类:

N_Shelf:CpG岛上游2-4 kbp

N_Shore:CpG岛上游0-2 kb

CGI: CpG岛

S_Shore:CpG岛下游0-2 kb

S_Shelf:CpG岛下游2-4 kbp

其示意图如下:

attachments-2019-02-mKWyJMck5c6f568a8cc60.jpg


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TCGA-甲基化生存分析

TCGA-生存分析

TCGA-基因差异表达分析

TCGA-ceRNA调控网络分析

TCGA-转录因子调控


  • 发表于 2019-02-22 09:54
  • 阅读 ( 7134 )
  • 分类:TCGA

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