从TCGA下载下来的甲基化数据中,最后一列Feature type ,是对甲基化位点的位置分类。主要包括5类:
N_Shelf:CpG岛上游2-4 kbp
N_Shore:CpG岛上游0-2 kb
CGI: CpG岛
S_Shore:CpG岛下游0-2 kb
S_Shelf:CpG岛下游2-4 kbp
其示意图如下:
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《TCGA-甲基化生存分析》
《TCGA-生存分析》
《TCGA-基因差异表达分析》
《TCGA-ceRNA调控网络分析》
《TCGA-转录因子调控》
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