目前DNA甲基化检测方法中,使用最多的还是illumina 的甲基化芯片。当然也有一些测序的方法检测甲基化,但是测序量太大,成本较高,使用不是很普遍。
illumina 的芯片其实有两种,可以基于原理的不同可以分为 Infinium I, 和 Infinium II 。两者的检测原理可以用如下这张图来展示:
Infinium I: 采用两个探针检测一个位点,分别是3‘端匹配和不匹配的探针。
Infinium II: 采用一个探针检测一个位点,采用单碱基延伸的技术,看延伸的是哪一种碱基。
由此可见Infinium II 的通量较Infinium I 通量高一倍。
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