illumina 甲基化检测原理

illumina 甲基化检测原理

目前DNA甲基化检测方法中,使用最多的还是illumina 的甲基化芯片。当然也有一些测序的方法检测甲基化,但是测序量太大,成本较高,使用不是很普遍。

illumina 的芯片其实有两种,可以基于原理的不同可以分为 Infinium I, 和 Infinium II 。两者的检测原理可以用如下这张图来展示:

attachments-2019-03-Kwe99vnV5c78f783e55af.jpg

Infinium I: 采用两个探针检测一个位点,分别是3‘端匹配和不匹配的探针。

Infinium II: 采用一个探针检测一个位点,采用单碱基延伸的技术,看延伸的是哪一种碱基。

由此可见Infinium II 的通量较Infinium I 通量高一倍。



如果您想学习TCGA数据挖掘,请学习的我TCGA系列课程:

TCGA-甲基化生存分析

TCGA-生存分析

TCGA-基因差异表达分析

TCGA-ceRNA调控网络分析

TCGA-转录因子调控

  • 发表于 2019-03-01 17:20
  • 阅读 ( 4635 )
  • 分类:甲基化

0 条评论

请先 登录 后评论
microRNA
microRNA

115 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 698 文章
  2. 安生水 347 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. 红橙子 78 文章
  7. rzx 74 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章