在线绘制聚类热图（heatmapper）
聚类热图是转录组测序类文章中常见的一种分析内容。今天小编就给大家讲解一个在线绘制聚类热图的方法。
我们使用的在线工具网址：
http://www.heatmapper.ca/expression/
打开后的页面是如下所示：
该在线工具有几个优点：
1、支持不同的颜色配置；
2、支持样品和基因的双聚类；
3、支持基因名称的显示；
4、支持多种格式图片的下载。
绘图之前，需要准备相应的数据文件。在这里小编使用的是基因的表达量数据来绘制聚类热图。
数据文件准备好之后，需要把该文件上传，上传完成之后需要稍等片刻（在线工具有延时），右侧图形展示区域就会显示聚类热图。再根据右侧参数进行相应设置即可完成聚类热图的绘制。
如果基因数目比较多，基因名称显示会不清晰，我们可以将图片下载下来，然后再使用其他软件进行修改，比如使用AI进行修改。
更多生物信息课程：
1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读
3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析
4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读
5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程
6. 生物信息入门到精通必修基础课，学习链接：linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图
7. 医学相关数据挖掘课程，不用做实验也能发文章，学习链接：TCGA-差异基因分析、GEO芯片数据挖掘、GSEA富集分析课程、TCGA临床数据生存分析、TCGA-转录因子分析、TCGA-ceRNA调控网络分析
8.其他课程链接：二代测序转录组数据自主分析、NCBI数据上传、二代测序数据解读。
- 发表于 2019-04-23 09:14
- 阅读 ( 14484 )
- 分类：科研作图
