在大家阅读文献的时候,应该经常能能看到下面这种图,这就是标准的——流式结果分析图,美观、简单、一目了然。
但是,很多时候,大家都做不出这种图,就算做出啦啦,结果也非常不好看,这个时候,你就要思考一下——你的实验对照设置好了吗?
有的同学说,我只是简单地检测一下细胞凋亡,就不需设置空白对照和单染对照,根据未处理组设定就行;
然而也有人说,你这样的对照设置是不可取的。
那么有关流式实验的对照设置,你的心中是否存在一些疑惑呢?
实际上,对照在任何实验中都是必不可少的,尤其在流式细胞术中,只有合理对照才可以将实验结果和背景区分,排除非特异性的效应,获得高质量的数据。
所以单一阳性对照已经很难满足其实验要求,只有对照设置的越充分,得到的实验结果才会越精准。
首先,我们需要了解非特异性信号产生的原因:
比如常见的肿瘤细胞自发荧光,会造成背景信号干扰;
又如,单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞和B细胞上,Fc受体均呈现高表达,在染色过程中抗体Fc端与细胞表面Fc受体的结合以及抗体与细胞的物理结合与粘附等,在这些细胞可能通过Fc结构域而不是抗原特异性Fab结构域与抗体发生结合,造成非特异性染色的发生;
除此外,样本中的死细胞不仅具有更强的自发荧光,而且更容易产生非特异性抗体的结合,造成假阳性。
为了避免上述情况,在流式抗体染色前需要使用Fc受体阻断剂和鉴别死细胞的活性染料对Fc受体及死细胞造成的非特异性染色加以去除。
除此之外,我们还需要根据实验具体情况设置五种对照来排除非特异性信号,下面将逐一讨论:
1. 空白对照(未染色对照)
对于细胞的自发荧光,可以设置空白对照用以区分细胞的自发荧光和特异性荧光。
2. 同型对照
在流式细胞术中,染色的背景水平是一个重要的影响因素,特别是在为罕见的低表达或者连续表达的细胞建立多色模板时,需要设置同型对照,同种型对照的作用是消除由于抗体非特异性结合到细胞表面的Fc受体及静电结合而产生的背景染色。
图:空白对照和同型对照的比较
如何选择同型对照?
一般选择相同种属来源、相同亚型和亚链、相同荧光标记但由未免疫动物血清纯化而来的抗体,比如抗鼠的CD11b BV711标记的抗体,成份是Rat IgG2b, κ。那么相应的同型对照应该是BV711标记的Rat IgG2b, κ Isotype Control。此外,需要注意的是,有些抗体的浓度和同型对照抗体的浓度不一致,使用时,应当以相同剂量为准。
在一些特殊情况下,我们可能会选择纯化的一抗+荧光标记的二抗的组合形式,这种情况下,应该选择一抗的同型对照,
比如:COX-2的纯化抗体,成分是Mouse IgG1,κ,其同型对照是纯化的Mouse IgG1,κ,荧光二抗是BV421标记的抗小鼠IgG1,染色方案如下:样本管:纯化的COX-2+BV421标记的抗Mouse IgG1(二抗)+样本;同型对照管:纯化的同型对照+BV421标记的抗Mouse IgG1(二抗)+样本。
3. 单染和补偿对照
由于荧光素发射光不是一个单一的波长,而是覆盖一定范围,
所以会有荧光渗漏到邻近波长的检测器,多色流式实验时,测量的颜色越多,越容易发生荧光渗漏,单染对照可以显示出不同荧光团之间光谱重叠的水平,并据此去除或补偿它们之间的重叠。
4. 荧光减一对照(FMO)
荧光减一对照(Fluorescence Minus One,FMO)是指实验设计里的所有荧光减去一个荧光后染色的细胞样本。
多色流式实验中,检测指标越多,越容易发生荧光溢漏,这非常影响设门的准确性,尤其是表达水平极低、需要从较大比例的阴性群体中识别阳性信号时,为了排除干扰信号,确定设门的准确性,FMO便显得尤其重要。
5. 生物学对照
生物学对照即我们所有实验都需设计的对照组,可以理解为文献中的Control或者是Vehicle组。
如细胞内染色实验涉及固定和透膜,这些步骤会影响抗原检测,自发荧光,荧光素亮度和细胞形态,生物学对照显得更为重要。
通过以上分析,我们可以发现,对照的正确应用能够使我们的实验结果更为清晰与准确。
在流式实验,尤其是多色流式中,对各种对照的充分理解与恰当应用是实验取得成功的前提,也是对实验者综合水平的一大考验。
愿大家能够从本文中有所收获,得出准确、漂亮的流式实验数据。
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实验流程大概是这样的:
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好了,学霸姐姐只能帮你到这里了,剩下的,就靠你自己了。。。
生物女学霸,一个自称学霸其实很渣的生物汪,
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