Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数,用法:
$gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1);
其中$fasta是总的序列;$start是提取序列的开始位置,由于Perl字符串是从0计数的,所以要减1;$end是提取序列的结束位置;$gene是提取的指定位置的序列。
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