Perl提取染色体序列指定范围的基因序列

Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数,用法: $gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1); 其中$fasta是总的序列;$start是提取序列的开始位置,由于Perl字符串是从0计数的...

Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数,用法:

$gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1);

其中$fasta是总的序列;$start是提取序列的开始位置,由于Perl字符串是从0计数的,所以要减1;$end是提取序列的结束位置;$gene是提取的指定位置的序列。

  • 发表于 2018-05-09 16:27
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  • 分类:perl

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安生水
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