venn图是转录组结果中的重要展示部分,能够找出各比较组之间共有和特有的基因,是最常用的转录组分析手段之一。但往往测序公司只给了几个固定组合的venn图,后期让公司补图,要加钱不说,两天给一副图的速度更是要命。
现在小编给大家讲一个在Windows下就能操作的,十分便捷的venn绘制方法:
一、输入数据准备:
首先要准备的是各比较组(比如CK1比上Treat1)的差异基因列表,一般公司做完的标准分析结果里已经包含这部分内容了,通常在“DEG_Analysis”文件夹里,我们需要的信息也不多,有差异基因的ID那一列即可,如下图第一列:
将各个比较组的差异基因ID整理到一个表里即可,对应关系要记好:
二、在作图网站填入数据:
打开网站:https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/
在输入部分黏贴刚刚准备好的数据:
这时你会发现在页面右侧,venn图已经做好了,我们再做些简单的调整就可以了:
当然我们也可以获得任一组合的共有基因列表:
ok,一张venn图就做好了,掌握之后,便可在几分钟之内做任意组合的venn图而不用求助于公司了!
其实转录组的很多后续分析,都不难,完全不必求助公司,您需要的仅仅是高手领进门。
常用转录组数据挖掘技巧
想获取最常用的8个转录组数据挖掘技巧,可以观看下面的教程,让你可以省时省力的做自己想要的分析。
课程链接:https://bdtcd.xetslk.com/s/22f7mb
或者直接扫码观看:
如果觉得我的文章对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!