tassel 软件做GWAS关联分析多年多点表型数据整理格式

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官方说明见:https://bitbucket.org/tasseladmin/tassel-5-source/wiki/UserManual/Load/Load#markdown-header-trait-format

Trait Format

This format does not require users to provide information on number of rows and columns. The file starts with the key word <Trait> followed by names of columns. The column for line should not be labeled and elements are tab delimited.

Example 1, Simple list of trait values:

attachments-2019-07-nSmnKaQ85d3551ba86c34.jpg

Example 2, Traits data collected in multiple environments:

attachments-2019-07-Dg6wOgfw5d3551cba2aa5.jpg


参考文献中示例数据:https://www.nature.com/articles/ng.3807#Sec32

https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fng.3807/MediaObjects/41588_2017_BFng3807_MOESM68_ESM.xlsx



  • 发表于 2019-07-22 14:03
  • 阅读 ( 6732 )
  • 分类:软件工具

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