evolview 3.0最新更新美化进化树

evolview 3.0最新更新美化进化树

以前我们讲解了evolview 2 来美化进化树:https://www.omicsclass.com/article/671

最近evolview 已经更新到全新的3.0版本:https://www.evolgenius.info/evolview/

又发了一篇NAR级别的文章,很是让人羡慕:

Balakrishnan Subramanian, Shenghan Gao, Martin J Lercher, Songnian Hu, Wei-Hua Chen, Evolview v3: a webserver for visualization, annotation, and management of phylogenetic trees, Nucleic Acids Research,(2019) (https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz357/5494715)

1.新建上传自己的tree文件:


attachments-2023-05-SqZY1MV3645b2a0c3119c.png
  1. Upload tree control icon
  2. Project name text box
  3. Tree name text box
  4. Select demo tree (for load trees from user guide tree examples)
  5. Select tree input format.
  6. Tree text editor: Paste the tree contents here. or use demo tree option to load trees from user guide examples.


2. 基础设置:


上传完成之后,可以点edit,做一些进化树的基础设置,和2.0差不多:


attachments-2023-05-acs41rN8645b2b4a1eb6e.png

3 高级设置 书写配置文件美化进化树

美化进化树的配置文件设置格式与2.0 差不多,这里就不多做赘述了:



attachments-2023-05-TJOEG3GN645b2abfbce4b.png



  • 发表于 2019-08-06 16:18
  • 阅读 ( 21939 )
  • 分类:软件工具

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