安生水
每天学习一点点
Linux三剑客之grep-文件中的信息捕获
在Linux系统中，grep（Global Regular Expression Print）是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行，并将其打印出来。今天，我们结合以下...
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- Ti Amo
- 发布于 14小时前
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Ti Amo
TWAS分析的原理和工具
TWAS（Transcriptome-wide Association Study）是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法，通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析，以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。
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- 每天学习一点点
- 发布于 14小时前
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exFAT格式的硬盘挂载问题
我们在挂载ntfs格式的硬盘的时候,一般可以正常使用linux命令,不会有啥问题,但是如果硬盘格式是exFAT,会发现有很多问题,比如权限不能改 如何判断自己的硬盘的格式?比如位置在/dev/sdb2,用以下代...
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- xun
- 发布于 1天前
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xun
omicsgene
单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌（HNSCC）(GSE181919)
数据介绍： 来自谷歌翻译： 肝细胞癌（HCC）代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里，我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组：原发肿瘤、门...
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- omicsgene
- 发布于 2024-10-31 14:05
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安装R包报错 fail to lock directory
这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录，这通常是因为之前的安装进程没有正确完成，导致锁文件（一个隐藏的文件，用于防止同时写入目录）仍然存在。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-10-29 17:32
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HiC-Pro 报错检索解决
报错： 运行HiC-Pro的时候出现报错： 去看log文件发现： 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找： 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件，看一...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-28 15:12
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R语言绘制多分组差异分析结果图
R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据
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- 安生水
- 发布于 2024-10-25 13:52
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igraph 报错： libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory
libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory
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- omicsgene
- 发布于 2024-10-24 12:02
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安装R包出现链接库缺失的问题
unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so': libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...
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- xun
- 发布于 2024-10-24 10:35
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perl报错：symbol lookup error: xxxxx: undefined symbol: Perl_xs_handshake
glimmhmm是一个基因从头预测的软件，他的运行需要先训练模型再预测基因 报错： 运行trainGlimmerHMM的时候出现报错”undefined symbol: Perl_xs_handshake“ 问题： per调用的lib里面没有相关...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-22 13:55
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删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy"
删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy"，是什么问题，如何解决
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-10-11 09:57
- 阅读 ( 258 )
ifconfig不显示ip
如题,在ifconfig的时候如果没有出现IP地址,同时确保自己网络连接没问题 nmcli con show NAME UUID TYPE DEVICE eno1 1377a295-708b-4cb4-a1cb-0...
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- xun
- 发布于 2024-10-10 15:57
- 阅读 ( 226 )
PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-09-30 13:50
- 阅读 ( 310 )
