3-5分蛋白质组学文章思路!
筛选出的蛋白怎么去进一步研究它呢?很多人还只停留在定量水平,蛋白质表达量肯定是一个值得考虑探究的因素,但是蛋白质的空间结构与其功能更是相关;蛋白质结构预测你会吗?今天给你分享一款很...
iTRAQ和TMT的区别?蛋白质组学分析依赖参考基因组么?分组混标原则?
采用R包STRINGdb 来进行蛋白互作网络分析
细胞作为生命的基本单位,必须利用其DNA中编码的信息来制造蛋白,因为蛋白对细胞结构至关重要,可以使细胞具有特定的形状和结构。根据中心法则,当DNA转录为RNA,RNA又被翻译成蛋白时,遗传信息则从DNA传递到RNA再到蛋白。那么影响蛋白表达的因素有哪些?又如何规避呢?
蛋白质定量—MaxQuant软件的使用
低成本小投入3分二区蛋白质组学文章!
蛋白质组分析软件MaxQuant
I-TASSER (Iterative Threading ASSEmbly Refinement) 1. 简介: I-TASSER是一个集成平台,用于预测蛋白质的三维结构和功能。它使用多个方法,如模板匹配、折叠识别和自由建模,来预测蛋白质结...
谷胱甘肽-S-转移酶(GST)是一个由211个氨基酸组成的大小为26kDa序列,它是另一种广泛使用的可提高靶蛋白的溶解度亲和标签。GST标签与固定化的谷胱甘肽具有亲和力,常用于原核表达。它可以与一个蛋白的N端或C端融合。 谷胱甘肽亲和是一种有效的一步纯化GST(谷胱甘肽S-转移酶)标签蛋白的方法。GST可作为一种可溶性蛋白在大肠杆菌细胞质中大量表达,并具有完全的酶活性。此外,许多在大肠杆菌中表达时不溶的真核蛋白,在表达为GST标签蛋白时被证明至少部分可溶。
蛋白质的分离纯化在生物化学研究应用中使用广泛,是一项重要的操作技术。 一个典型的真核细胞可以包含数以千计的不同蛋白质,一些含量十分丰富,一些仅含有几个拷贝。为了研究某一个蛋白质,必须首先将该蛋白质从其他蛋白质和非蛋白质分子中纯化出来。
在 蛋白质定量—MaxQuant软件的使用 这篇文章中介绍了如何使用MaxQuant进行蛋白质定量。但是只适用于样品少(11个样品以内)的分析,但是如果样品特别多(比如有18个样品)时,标记是不够用的,...
之前小编在蛋白质定量—MaxQuant软件的使用这篇文章中分享了Maxquant软件的使用方法。分析完成后会产生很多的结果文件,第一次使用的同学可能会很困惑,这里再给大家介绍一下如何查看其结果文件...
蛋白质三维结构美化pyMOL软件
omicsclass的朋友们,大家好啊、、、、、、、、、、、、、、、
RIP是研究体内蛋白与RNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联细胞内的“蛋白-RNA”互作复合物,裂解细胞后,用靶蛋白特异的抗体(或标签抗体)做免疫沉淀,获得“靶蛋白-RNA”互作复合物,
蛋白质组合转录组相关性图绘制
proteusTMT 分析蛋白质组数据时,meta文件的格式设置非常重要
定量蛋白质组分析的R软件包proteus
蛋白质组学和转录组联合分析该如何做?