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绘制Upset 图

Upset 图（Upset Plot）是一种用于可视化集合间交集的图表，是传统维恩图的替代方法，特别适用于集合个数多或交集关系复杂的场景。它通过柱状图、点图和辅助条形图来直观展示集合交集的大小及分布。

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-28 11:01
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R 安装github包报错：

R 安装github包报错：

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-18 15:42
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R公式中如何加入变量

expression（）函数是没办法同时代入公式和变量，这个时候我们可以使用另一个函数来替代——bquote（）

空间转录组数据读取

10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-13 16:56
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R语言基础入门—数据结构（2）

R语言基础入门—数据结构（2）

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:55
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R语言基础入门—数据结构（1）

R语言基础入门—数据结构（1）

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:50
  • 阅读 ( 301 )

R语言基础入门—R语言概述与安装！

R语言基础入门—R语言概述与安装！

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:43
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Upset图绘制

Upset图绘制

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 16:27
  • 阅读 ( 341 )

安装R包报错 fail to lock directory

这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录，这通常是因为之前的安装进程没有正确完成，导致锁文件（一个隐藏的文件，用于防止同时写入目录）仍然存在。

R语言绘制多分组差异分析结果图

R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据  

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  • 安生水
  • 发布于 2024-10-25 13:52
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安装R包出现链接库缺失的问题

 unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so':  libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...

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  • xun
  • 发布于 2024-10-24 10:35
  • 阅读 ( 318 )

R语言绘制差异表达火山图

R语言绘制差异表达火山图

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  • 安生水
  • 发布于 2024-10-14 15:48
  • 阅读 ( 419 )

R语言中%>% 作用

R语言中%>% 作用

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  • 安生水
  • 发布于 2024-09-02 14:24
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libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

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  • 安生水
  • 发布于 2024-08-22 15:05
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group_by()和any()连用判断每个分组中的元素是否满足特定条件

如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组，然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。

绘制全基因组甲基化图谱

绘制全基因组甲基化图谱

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  • 安生水
  • 发布于 2024-07-25 14:08
  • 阅读 ( 721 )

R语言跑循环，如何跳过报错信息？

当使用循环跑R函数的时候，如果其中某一次循环执行时报错，那么就会中断循环体，并在屏幕上打印出报错信息

对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？

我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包

eQTplot包绘图报错解决：“Caused by error in `db_collect()`”

解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题

eQTpLot包的安装

eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包，专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入，以生成一系列图表，可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。