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R语言“had non-zero exit status”安装报错

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  • 星莓
  • 发布于 2024-03-05 10:53
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R语言按列合并文件，并保持其中一个文件的原有顺序

1.join函数；2.创建新的顺序变量；3.inner_join函数

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  • 星莓
  • 发布于 2024-01-30 17:49
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在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件

libpcre2-8.so.0是PCRE（Perl Compatible Regular Expressions）库的一个版本，通常用于支持正则表达式。

ggtree绘图lable显示不全如何调整

解决ggtree绘图lable显示不全的问题

一些常见R代码的报错和解决办法

Error: cannot allocate vector of size X Gb 这种问题尤其在32位R版本中常见，因为它们对可用内存有限制。即使在64位版本中，当数据集非常大时也可能遇到内存问题。解决这个问题通常需要优化...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-25 14:39
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对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？

我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包

R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程

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  • 星莓
  • 发布于 2024-02-23 17:10
  • 阅读 ( 1004 )

R语言使用ggraph绘图导出pdf报错——“invalid font type”

使用ggraph绘图，在结果导出pdf的时候报错，不可用的字体类型“invalid font type” 如果继续使用ggsave导出，可以直接载入字体： library(showtext) font_add('Times','/Library/Fonts/T...

R语言-文件行名重复，对行名重命名

R语言对重复的行名进行重命名操作

R| set.seed()作用使随机结果具有复现性

例如在R语言中，rnorm()函数为随机生成多个随机数，每次使用都会得到不同的结果 > rnorm(3) [1] -2.0235077 0.3552526 0.6239982 > rnorm(3) [1] 1.101044 -1.297740 1.717356 如...

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  • rzx
  • 发布于 2024-02-19 14:26
  • 阅读 ( 968 )

make Cladogram with microbiomemarker

给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram，直接附上代码： if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager")}​BiocManager::install("microbiomeMark...

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  • xun
  • 发布于 2023-12-28 11:11
  • 阅读 ( 917 )

topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes()，其中提供的第二个参数不能有0，否则会报错： showSigOfNodes()拆分之后是： sampleGOdata和score(resultKS.elim)是提供给函数的       ...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-22 11:51
  • 阅读 ( 882 )

绘制venn图报错Unexpected parameter length for "category"

在进行韦恩图绘制的时候出现报错： 出现这个报错的原因是在输入数据应当是一个有名字的list，要求是这个list中的每个元素都有名字。 venn <- list(A,B,C)names(venn) <- c("A","B",...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-03-01 17:25
  • 阅读 ( 861 )

使用compare_means（）t.test进行显著性检验时报错

compare_means（）函数进行t.test时报错——“not enough 'x' observation”

桑基图绘制

桑基图是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名，此后便以其名字命名为“桑基图”。...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-23 17:49
  • 阅读 ( 856 )

R中的错误处理函数

很多时候简单的try函数就能够增加脚本的鲁棒性，随着脚本逐渐复杂，一些较高级的错误处理函数就必不可少了，我们今天来介绍几个R中的 1. tryCatch() 函数 功能: tryCatch() 函数是一种更复杂...

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  • xun
  • 发布于 2023-12-19 14:39
  • 阅读 ( 856 )

R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-16 15:38
  • 阅读 ( 805 )

基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:45
  • 阅读 ( 793 )

使用R语言安装包编译时gcc标准报错——“error: for loop initial declarations are only allowed in C99 mode”

使用BiocManager安装R包时gcc标准报错

R 包 osqp安装报错

R 包 osqp安装报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-14 23:13
  • 阅读 ( 668 )