R - 文章 - 第2页 - 组学大讲堂问答社区

使用R语言安装包编译时gcc标准报错——“error: for loop initial declarations are only allowed in C99 mode”

使用BiocManager安装R包时gcc标准报错

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每天学习一点点
发布于 2024-01-26 10:52
阅读 ( 637 )

桑基图绘制

桑基图是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名，此后便以其名字命名为“桑基图”。...

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Ti Amo
发布于 2024-01-23 17:49
阅读 ( 680 )

topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes()，其中提供的第二个参数不能有0，否则会报错： showSigOfNodes()拆分之后是： sampleGOdata和score(resultKS.elim)是提供给函数的 ...

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Ti Amo
发布于 2024-01-22 11:51
阅读 ( 736 )

R语言使用ggraph绘图导出pdf报错——“invalid font type”

使用ggraph绘图，在结果导出pdf的时候报错，不可用的字体类型“invalid font type” 如果继续使用ggsave导出，可以直接载入字体： library(showtext) font_add('Times','/Library/Fonts/T...

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每天学习一点点
发布于 2024-01-11 14:14
阅读 ( 775 )

使用compare_means（）t.test进行显著性检验时报错

compare_means（）函数进行t.test时报错——“not enough 'x' observation”

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每天学习一点点
发布于 2024-01-04 09:57
阅读 ( 718 )

make Cladogram with microbiomemarker

给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram，直接附上代码： if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager")}BiocManager::install("microbiomeMark...

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xun
发布于 2023-12-28 11:11
阅读 ( 775 )

R中的错误处理函数

很多时候简单的try函数就能够增加脚本的鲁棒性，随着脚本逐渐复杂，一些较高级的错误处理函数就必不可少了，我们今天来介绍几个R中的 1. tryCatch() 函数功能: tryCatch() 函数是一种更复杂...

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xun
发布于 2023-12-19 14:39
阅读 ( 715 )

ggtree绘图lable显示不全如何调整

解决ggtree绘图lable显示不全的问题

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每天学习一点点
发布于 2023-11-16 14:47
阅读 ( 935 )

R 包 osqp安装报错

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omicsgene
发布于 2023-11-14 23:13
阅读 ( 526 )

绘制venn图，2-7维

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omicsgene
发布于 2023-11-13 13:59
阅读 ( 754 )

arrow 安装失败可

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omicsgene
发布于 2023-11-12 07:58
阅读 ( 561 )

R 包RIdeogram安装报错

安装R 包RIdeogram时需要下载rsvg，rsvg的安装出现librsvg-2.0的缺失的解决办法

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Ti Amo
发布于 2023-11-10 14:49
阅读 ( 1026 )

快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

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omicsgene
发布于 2023-11-08 10:29
阅读 ( 1391 )

安装R包报错C++17

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安生水
发布于 2023-10-17 17:09
阅读 ( 840 )

R magick 包安装包错

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omicsgene
发布于 2023-10-10 19:50
阅读 ( 1209 )

使用R包(VennDiagram)进行韦恩图绘制时相关参数调整

介绍一些VennDiagram常用的绘图参数

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每天学习一点点
发布于 2023-09-13 10:48
阅读 ( 1779 )

R 相关性系数计算 cor() 报错

转录组分析时，计算完FPKM后进行相关性计算并绘图，出现报错： Error in seq.int(0, 1, length.out = n) : 'length.out' must be a non-negative number 该报错发生在选择颜色的函数colo...

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Ti Amo
发布于 2023-09-06 10:01
阅读 ( 753 )

ggsci 的颜色可视化

ggsci提供了一系列高质量的调色板，让我们可以快速绘制出配色舒适的图，这些调色板的灵感来自于科学期刊、数据可视化库、科幻电影和电视节目中使用的颜色。但是这些调色板具体包含了哪些颜色呢？他们的16进制代码是什么呢？在这里，我们提供一种方法可以快速看到ggsci中各种调色板包含的颜色，便于大家随意取用与组合，使自己的图形更加美观。