R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题，相关解决方法： 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况（MB） 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-29 13:16
• 阅读 ( 3645 )

R 删除重复数据

R 删除重复数据的方法，包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候，返回逻辑值，以下面的数据框为例：  dat   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-27 22:00
• 阅读 ( 4086 )

Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用

系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）— 最短距离法（single linkage)— 最长距离法 （complete linkage)— 中间距离法 （median method)— 可变距离法 （flexible median)— 重心...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-22 12:11
• 阅读 ( 6240 )

ggplot2几何设置——geom

列举ggplot2的geom设置内容，方便查找绘图对应方法

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-22 09:59
• 阅读 ( 4930 )

火山图--ggplot2

利用ggplot2进行火山图的绘制

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-15 09:59
• 阅读 ( 6936 )

melt函数对数据进行整合

借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理，改变数据组合方式

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-15 09:30
• 阅读 ( 2778 )

绘制类似于箱线图的散点图

使用R语言绘制类似于箱线图的散点图

• 0
• 0
• 安生水
• 发布于 2018-06-08 12:06
• 阅读 ( 5534 )

linux系统当中源码安装R，无root权限安装

1.安装zlib1.2.5版本及以上 cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install 2.安装bzip cd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz...

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-06-02 18:03
• 阅读 ( 5528 )

R-对NA 数据进行处理

对数据中存在的NA情况进行处理，替换或者删除

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-01 13:54
• 阅读 ( 2372 )

R数据集合并

在进行数据集处理时，经常会合并两个数据集，这里说一下合并数据集常用的2个函数： 合并列：cbind 合并行：rbind 1.cbind cbind使用非常直观简单。当我们需要直接合并2个矩阵或数据框，不需...

• 0
• 0
• 安生水
• 发布于 2018-06-01 13:03
• 阅读 ( 2895 )

这种机器学习算法已经在微生物分析中成功应用

《Nature》发文证明了某种机器学习算法能够对微生物群落样本进行有效且准确的分类，并且可以找出能够区分组间差异的关键成分（OTU或物种）。本文介绍了该算法的实现形式和应用。

• 1
• 0
• 安生水
• 发布于 2018-04-22 10:58
• 阅读 ( 5198 )