Daitoue
分组柱状图添加误差线（位置）--ggplot2
分组柱状图的绘制可以基于ggplot2，具体可以参考: 分组柱状图--ggplot2 。 如何针对分组柱状图添加误差线并合理调整位置呢？主要基于geom_errorbar及其参数position进行细节调整。 譬如基于上...
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- 发布于 2018-12-04 11:16
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R语言scale()标准化
R语言中scale函数，可以对数据进行处理，标准化（归一化）在一定的范围，比较适合大范围变化数据归一化处理从而观察数据变化趋势 scale()函数 scale(x, center = TRUE, scale = TRUE) x一般...
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- 发布于 2018-11-23 14:52
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microRNA
对R包的操作（查询、版本、更新等）
R中对包进行操作的命令很多，涉及从包的安装、查询、更新、卸载等等。这里介绍几个常见的操作
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- 发布于 2018-10-24 16:01
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pheatmap返回的结果解释（获得新的排序信息）
pheatmap是一个热图绘制的R包，全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap()，对应的数据则是一个数值矩阵，譬如基于如下的矩阵10X6： > mat CK-WT-1 CK-WT-2 ...
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- 发布于 2018-10-19 14:23
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ggplot2点图geom_point中点的shape有多少？
ggplot2可以利用geom_point绘制散点图，而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢？(注意此处只介绍shape的设定，不是aes(shape)映射） 可以通过查询?shape 获得以下内容： # Shape exampl...
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- 发布于 2018-09-30 16:59
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ggplot2图例位置legend.position调整
ggplot2绘图过程种，控制图例在图中的位置利用theme(legend.position）参数 该参数对应的设置如下： legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or...
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- 发布于 2018-09-13 18:19
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ggplot2 笛卡尔坐标系x、y轴互换
利用ggplot2进行x、y坐标轴互换只需借助coord_flip()即可，譬如，以ggplot2绘图代码 http://www.omicsclass.com/article/92 为例，添加一个坐标互换函数，实现互换 library('ggplot2')libr...
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- 发布于 2018-08-24 13:40
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R 语言colors()657种颜色
R进行绘图多会涉及颜色搭配问题，利用colors()可以获得R种的657种颜色名称。 head(colors(),20) [1] "white" "aliceblue" "antiquewhite" "antiquewhite1" [5] "antiquewhite2" "...
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- Daitoue
- 发布于 2018-08-10 14:29
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omicsgene
ggplot2 绘图 离散型颜色选择 ColorBrewer
利用ggplot2绘图 scale_fill_brewer() 或者scale_color_brewer() 会使用到ColorBrewer 配色。可以利用相关的命令查看改配色方案。 library(ggplot2)RColorBrewer::display.brewer.all() 通...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-13 16:53
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统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图
R统计不同差异组合，上下调基因个数；并用ggplot2绘制柱状图。
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-03 14:02
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readxl包读取excel的多个函数简介
readxl包括多个可以读取excel的函数，比之xlsx包更方便
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-15 16:09
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smyang2018
