Daitoue
ggplot2 绘图 离散型颜色选择 ColorBrewer
利用ggplot2绘图 scale_fill_brewer() 或者scale_color_brewer() 会使用到ColorBrewer 配色。可以利用相关的命令查看改配色方案。 library(ggplot2)RColorBrewer::display.brewer.all() 通...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-13 16:53
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GEOquery 读取本地表达矩阵压缩包
利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载，不过，有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错，可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中： 矩阵文件的基本命名格式...
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- 发布于 2018-07-06 16:00
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omicsgene
Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色
Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-04 12:02
- 阅读 ( 8894 )
统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图
R统计不同差异组合，上下调基因个数；并用ggplot2绘制柱状图。
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-03 14:02
- 阅读 ( 11046 )
R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图
统计相同ID出现的频率，并用ggplot绘制柱状图；
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-01 15:46
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R处理大数据时内存out of memory的问题
R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题，相关解决方法： 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况（MB） 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-29 13:16
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Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用
系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）— 最短距离法（single linkage)— 最长距离法 （complete linkage)— 中间距离法 （median method)— 可变距离法 （flexible median)— 重心...
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-22 12:11
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readxl包读取excel的多个函数简介
readxl包括多个可以读取excel的函数，比之xlsx包更方便
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-15 16:09
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安生水
如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol
AnnotationDbi 和 结合物种对应的注释文件，将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-07 18:30
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