R脚本报错|URL 'https://raw.githubusercontent.com/YinLiLin/R-CMplot/master/R/CMplot.r': Timeout of 60 seconds was reached

在运行R脚本的时候,出现报错,提示CMplot这个包连接超时。 Error in file(filename, "r", encoding = encoding) :  cannot open the connection to 'https://raw.githubusercontent.com/YinLi...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-29 13:37
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ggplot 柱状图,y轴从0 开始,最高柱子 留有余地代码:

ggplot 柱状图,y轴从0 开始,最高柱子 留有余地代码:

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-06-08 17:34
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R安装units包报错解决方法

R安装units包报错解决方法

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  • 安生水
  • 发布于 2023-06-08 14:25
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flowCore R包安装报错

flowCore

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-04-17 13:44
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解决Rstudio Server卡顿问题

在使用Rstudio Server出现卡顿,或者每次打开server都会加载之前的工作。 解决方法: 1. 清除工作区内项目信息 2. 在Termianal页面下删除session rm -rf ~/.local/share/rstudio/sessions...

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  • rzx
  • 发布于 2023-04-07 15:39
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pophelper包安装

pophelper包安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-30 10:10
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dQTL.seq方法研究基因定位

dQTG.seq方法包含dQTG.seq1、dQTG.seq2、smoothLOD、C'、Δsnp index、ED六种计算方法。 其中dQTG-seq1方法利用F2群体极端池标记等位基因数目来预测其基因型数目,通过观测的标记等位基因数目和...

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  • rzx
  • 发布于 2023-03-29 11:56
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R语言数据整理——tidyr包

tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表(pivot table)的功能 tidyr包主要涉及: 1)长宽数据转换;2)列分割与列合并;3)缺失值的简单补齐

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-24 15:57
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R语言用tidyr包进行长宽数据转换

长型和宽型数据在数据分析中非常常见。 之前我们进行长宽数据转换使用较多的包是reshape或reshape2,原作者新推出的tidyr包对数据整合更加优秀,让我们一起来学习一下如何使用tidyr包进行长宽数据转换。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-15 18:06
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R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包

1. psych包的corr.test()函数 2. Hmisc包的rcorr()函数

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-07 13:14
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R 安装magick 报错

R 安装magick 报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-02-26 20:53
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R及R包的更新、移除、卸载

之前的笔记分享过安装R包的三种方法,以下是关于R及R包的更新、卸载和删除。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-02-22 11:21
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textshaping L <stdin>:1:19: fatal error: hb-ft.h: No such file or directory

textshaping

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-02-17 15:26
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R使用ggtree包报错

报错信息:Error: package or namespace load failed for ‘ggtree’: object ‘get_aes_var’ is not exported by 'namespace:rvcheck' 原因是rvcheck版本过高,降级即可 remove.packages("rvchec...

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  • xun
  • 发布于 2023-02-15 14:15
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R报错‘length(x) = 12 > 1' in coercion to 'logical(1)’

运行R报错: 解决: 将脚本中group$group == treat || group$group == control中“||”改为“|”,即改成group$group == treat | group$group == control || 和 | 都是表示“或”,区别是||只要满...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-10 14:26
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安装R包的几种方法

1.从CRAN安装;2.使用BiocManager安装;3.从github安装

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  • 星莓
  • 发布于 2023-01-14 15:20
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ggforestplot error: Error in assertAndRetrieveTidyValue(x, mean) : argument "x" is missing, with no default

使用ggforestplot绘制森林图时,有时候会报如标题所示的错误 实际上,这不一定是因为缺失参数,也有可能是因为加载了forestplot包,这两者的语法存在交叉,所以如果同时加载,就可能出现错误,...

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  • xun
  • 发布于 2022-12-19 13:42
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ggtern 安装报错

ggtern 安装报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-14 23:51
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r绘图0不在原点的问题

使用plot画图的时候,只是设定xy轴范围仍然在0之前会有一小段多出来的范围 例如:plot(runif(10,0,10),type="l",xlim=c(0,10),ylim=c(0,10)) 使用:xaxs/yaxs="i" 代码即可解决 例如:plot(r...

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  • xun
  • 发布于 2022-10-21 17:29
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用R语言快速合并大量表格文件

合并文件

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-10-14 10:33
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