SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”
SRA Toolkit 是一套由 NCBI (National Center for Biotechnology Information) 开发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-09-09 16:31
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每天学习一点点
pfamscan程序-translate和python的translate冲突问题
pfamscan程序-translate和python的translate冲突
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- Ti Amo
- 发布于 2024-08-27 16:44
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Ti Amo
安生水
xun
MITE_Hunter 第六步报错 aln not exits
MITE属于II类非自主转座因子，可以使用MITE_Hunter进行检测，MITE_Hunter的运行一共有8步。 1. 报错信息 在运行第六步（-S 6）的时候出现报错： 2. 报错原因 发现第六步执行： 在MITE_...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-08-05 10:36
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火山云 | tos:// 数据下载 | windows/linux下载方式
01：windows | 通过 共享链接 登录 TOS Browser 软件（版本> v1.7.0）下载 01-1:在本地电脑下载TOS Browser 软件，安装包网址：https://www.volcengine.com/docs/6349/148777 01-2：双击...
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- rzx
- 发布于 2024-08-01 11:34
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rzx
qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度
qsub全称为”Queue Submitter”，是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中，等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-06-26 17:54
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蛋白质组学数据定量搜库 | MaxQuant软件的使用
简介： MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一，免费使用，目前认可度相对较高，可针对多种质谱数据格式（.raw、.wiff、.mzML、.mzxml）。且内置了自己的肽段搜索引擎-...
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- rzx
- 发布于 2024-06-26 11:52
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ProteoWizard工具的安装与使用
ProteoWizard 是一套用于蛋白质组学数据分析和转换的开源软件工具，它支持多种质谱数据格式转换、可以用于谱图查看、质谱仪器参数查看、还可以用于蛋白序列模拟酶切…… ProteoWizard官网：https...
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- rzx
- 发布于 2024-06-14 15:13
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gtfToGenePred报错
使用gtfToGenePred的命令和报错： gtfToGenePred -genePredExt Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-06-13 11:47
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cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2
Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。
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- rzx
- 发布于 2024-04-30 17:41
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htop查看程序的io占用
传统的top大家都用的很多,但是top里不会显示磁盘io,而在我们服务器里,磁盘高io往往才是程序运行的瓶颈 新版 的htop新增了io 的查看,读写过高对应选项会变成红色,方便我们查看,除此之外htop还有...
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- xun
- 发布于 2024-04-25 11:03
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NCBI 基因组文件下载——datasets
datasets和dataformat是NCBI的命令行（Command line tools）工具，datasets可以下载ncbi上的生物数据，dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-04-24 16:52
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转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo
转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo
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- 安生水
- 发布于 2024-04-01 11:36
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