NCBI数据库当中下载基因组序列,cds序列,蛋白质序列等

NCBI下载物种基因组的信息

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-01 10:30
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dell 服务器R430硬盘移除报错

dell服务器R430硬盘点击阵列卡

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  • 发布于 2018-07-31 13:40
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Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护

Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护

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  • 发布于 2018-07-31 11:32
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Mapman对表达数据进行聚类分析

Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物代谢通路注释+基因表达可视...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-27 10:17
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做韦恩图?自己搞定!

韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具,简单易学!

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-26 11:08
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利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域

搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-23 12:11
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Muscle 进行多序列比对

MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:53
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blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:13
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植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

你可以对基因进行功能注释,分析其功能分类以及相关的通路信息,你也能分析基因的表达谱数据,但是你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-20 09:18
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科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop,用好了这两个软件也会使你的文章配图增色不少,甚至事半功倍。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-19 11:47
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java 安装以及环境变量配置

配置JAVA环境,运行java程序

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-18 22:38
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在线版fimo程序做转录因子结合位点预测

meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点,这里介绍一下他的在线版用法。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 14:27
  • 阅读 ( 7398 )

python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

手把手教你多个基因组共线性作图。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-12 17:14
  • 阅读 ( 26570 )

GOrilla-一个在线GO富集分析的网站

在线GO富集分析

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-11 10:38
  • 阅读 ( 16334 )

MCScanX 在biolinux上安装及使用

MCScan安装与共线性分析练习

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 13:58
  • 阅读 ( 25014 )

blast报错

在刚开始按官网教程(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279680/)学习使用blast时,经常会遇到程序报错

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 15:00
  • 阅读 ( 11707 )

BLAST+使用方法

BLAST+是使用非常广泛的序列比对软件,有NCBI提供

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:36
  • 阅读 ( 6587 )

dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

之前在做dcaps标记,开始只找到网站版的软件,后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:21
  • 阅读 ( 6064 )

小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 09:07
  • 阅读 ( 13547 )

DNA SequenceLogo

快速绘制DNA Logo

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:39
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