pfam打开不了解决办法,Pfam这个主页里,这些搜索项目点击没有反应,是咋回事呢
相近功能基因的检索方法,如何利用pfam数据库下载隐马尔科夫hmm文件。
MEGA进行遗传进化分析,揭示不同种群间遗传进化关系和环境适应性机制。
MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解,是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具,结果输出一般是有四个文件,motif的图形展示文件(LOGO),txt文本,html的网页信息文件及xml...
用基因ID提取其序列很简单,ctrl+F找到ID对应的序列,ctrl+C、ctrl+V就好了,少量基因的还OK,但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽? 这里墙裂推荐一个软件,功能很强大,就是TBtoo...
今天介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server,简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构,清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制...
使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行,所以使用前记得要安装JAVA。 第一步:选择合适的树形 使用File – open 打开树文件(一般为.nwk文件),在左上方绿色...
参考基因组下载,Ensembl,NCBI,JGI等网站下载使用,可视化浏览,基因查看与下载等;
PubMed 按影响因子过滤文献
用迅雷替代官方的prefetch批量下载SRA测序数据,更快更稳定!
简单高效的查找外源基因插入位置的方法,并可以设计共显性标记,方便后续实验验证。
学术界的“盗版女王”,哈萨克斯坦研究生兼女黑客亚历山德拉·埃尔巴克彦。文末附可用链接,再也不用担心下载不到文章了。
今天主要介绍一下Phytozome网站基因组如何下载,通过blast查询多个物种中得同源基因,以及根据基因相关功能结构域等批量下载相关基因的CDS,PEP等序列信息;
由于很多生物学软件都是基于Java开发的,因此想要使用这类软件就必须有Java的运行环境。今天小编就给大家介绍如何在Windows上安装Java。
fasta是常用的序列存储格式,很多软件(如GATK、IGV等)在导入序列以及进行快速查找时通常需要建立索引文件。本文介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。
在做微生物多样性分析时,经常会接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn,用它生成的图会更好看哦!
作为常用的正选择分析方法,计算Ka/Ks方法较为严格。本文介绍利用Sites Model方法来分析正选择基因。
一本系统详尽讲述植物病毒的书-Plant Virology Protocols(文末有获取方式),堪称病毒学研究里程碑式巨制。主要内容是如何鉴定组装植物病毒!
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双因素方差分析,依然是简单、快捷、方便!