三代测序在检测基因组结构变异方面有着很大的优势,但是由于数据分析算法、软件还处于不断开发更新中,当前还没有公认推荐的软件。这里为大家推荐一款国人开发的三代数据SV检测软件—cuteSV。该...
使用vcftools对vcf文件做滑窗处理
统计每个窗口内SNP变异位点数量
linux使用ossutil下载阿里云数据
muscle新版,旧版使用的一些差别
从fasta基因组中提取反向互补序列,借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件 -bed 基因位置 共6列:【染色...
大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构,即由LSC、SSC以及一对IR区域构成,IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比...
对vcf文件排序
GenotypeGVCFs 运行速度慢解决方法
SSR (Simple Sequence Repeat),即简单重复序列,是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,也称为微卫星序列或者串联重复。
保姆式教程!手把手教你使用Simplot,绘制高大上的序列相似性图片
Win11怎么关闭Hyper-V?关闭Hyper-V的2种方法
Win11彻底卸载WSL2系统(去除导航窗格Linux图标)
基于WSL2的docker更改存储位置
bwa-mem2( https://github.com/bwa-mem2/bwa-mem2 )
motif分析及meme的各项参数
fasta序列多行变单行
使用orthomcl分析同源基因时的 mysql数据库操作
win11安装docker
筛选出能比对到参考序列的reads,形成新的fastq文件