生信阿姨
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- 生信阿姨
- 发布于 2022-10-19 09:42
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进化树美化操作详解- iTOL
绘制进化树，是科研人的基础技能之一，而一张好看的进化树图，不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系，更能增加文章的观赏性，赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...
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- rzx
- 发布于 2022-10-12 15:53
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rzx
关于CodeML分析中Branch-Site模型假设
branch-site models 类似于branch model和site model的合集，主要假设基因的不同位点间（site）和系统发育树的不同分支间（branch）的ω值均是变化的，目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...
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- rzx
- 发布于 2022-10-10 17:12
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关于CodeML分析中四种常见模型假设
codeml是PAML软件包下的一个程序，在估算蛋白编码序列同义替换和非同义替换速率以及检测序列是否经受正选择分析中受到广泛应用。 对于一棵系统发育进化树，在考虑其不同序列间（site）和不同支...
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- rzx
- 发布于 2022-10-10 15:41
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安生水
Clustal Omega多序列比对使用方法（命令行及在线网站）
Clustal Omega是欧洲生物信息研究所（EBI）开发的多序列比对排列工具，现已经完全取代了之前ClustalW的地位。最新本的omega比对准确度更高，而且速度更快，适合大规模的多序列比对。
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- 星莓
- 发布于 2022-09-09 14:21
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星莓
itol添加圆环分组和节点标签时位置调整
在进行iTOL绘制进化树时，需要导入分组圆环或者节点标签的配置文件。最后选择了单个文件上传，在调整好上一圈标签的位置后再导入下一个文件，这样就不会相互影响了。
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- rzx
- 发布于 2022-09-05 11:39
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下载和安装软件遇到问题：下载：Microsoft Edge通常不会下载请在打开前确保信任，安装:Microsoft Defender SmartScreen 阻止了无法识别的应用启动,存在风险。以TBtools举例
解决办法如下 Microsoft Defender Smartscreen 关掉即可下载 接下来是安装 如果遇到Microsoft Defender SmartScreen 阻止了无法识别的应用启动。运行此应用可能会导致你的电脑存在风险。...
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- 生信阿姨
- 发布于 2022-08-26 10:03
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0.1元学习《Docker在Linux系统中安装与使用》
docker作为一个虚拟化工具，可以让我们直接使用镜像里面的生信分析软件分析我们的数据，省去安装linux软件的麻烦，对于初学linux的学员非常有用。 我们的《Docker生物信息工具安装与使用》课程...
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- 生信老顽童
- 发布于 2022-08-19 11:59
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生信老顽童
你想桃子吗
Uniprot蛋白数据库介绍及使用详解！
Uniprot数据库是资源最广、信息最丰富的蛋白质数据库，是查询蛋白功能的首选数据库。Uniprot数据库由Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD三大子数据库构成，数据主要来自于各物种基因组测序完成后得到...
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- 红橙子
- 发布于 2022-01-19 22:26
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红橙子
蛋白信号肽预测—SignalP使用详解
信号肽是是引导新合成的蛋白质向分泌通路转移的短肽链，长度约5-30个氨基酸；对应的mRNA序列，在起始密码子后，有一段编码疏水性氨基酸序列的RNA区域，该氨基酸序列就被称为信号肽序列，它负责...
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- 红橙子
- 发布于 2022-01-19 22:17
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基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用
上一期给大家介绍了信号肽的预测方法，详见：蛋白信号肽预测—SignalP使用详解，今天继续给大家分享一款简单好用的核酸、蛋白序列结构绘图软件，该软件可以轻松绘制出序列的各种序列结构，可以让...
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- 红橙子
- 发布于 2022-01-19 22:14
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如何预测同一基因不同转录本对应蛋白的功能域差异
在真核生物中，由于转录后可变剪接的存在，赋予了基因更多的功能，一个基因会产生多个mRNA，不同mRNA所翻译出来的蛋白功能是有很大差异的，那么了解不同转录本翻译的蛋白各是什么功能是一个非常...
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- 红橙子
- 发布于 2022-01-19 22:08
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如何预测蛋白质保守结构域？-InterPro在线工具使用详解
Domain-结构域分析是研究蛋白功能时不可或缺的分析项，那么如何去预测蛋白的保守结构域呢？以前我们给大家分享过NCBI提供的CD-search工具的使用，详情请点击链接学习：如何正确预测基因的保守结...
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- 红橙子
- 发布于 2022-01-19 21:53
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科研人员必备-护眼神器CareUEyes
科研人员最累的是哪里？有人肯定会想到是脑子，其实眼睛比大脑更累，上班居家各种电子屏幕几乎占据了除睡眠外的全部时间，尤其喜欢生信的朋友，看脚本、打代码更是累眼！爱护科研人的眼睛急需行...
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- 红橙子
- 发布于 2022-01-19 21:40
- 阅读 ( 2334 )
