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blast 建库报错：blast options error: *.fa does not exist
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- 每天学习一点点
- 发布于 2023-08-02 00:32
- 阅读 ( 1483 )
每天学习一点点
xshell双击复制分隔符设置
使用xshell时有很多方便的小技巧，一般习惯左键双击复制，右键粘贴，设置方法如下： 打开xshell => 工具 =>选项 =>键盘和鼠标 =>向右按钮（选择以paste开头的） => 勾选“将选定...
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- 星莓
- 发布于 2023-07-26 16:51
- 阅读 ( 1211 )
星莓
easySFS的使用
位点频谱SFS (site frequency spectrum)，用来显示一个种群中特定基因座上各个等位基因所占的频率。easySFS是一种高效构建位点频谱的工具，它可用于将VCF转换为dadi/fastsimcoal/momi2可接纳的格式进行人口统计分析。
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- Ti Amo
- 发布于 2023-07-20 15:10
- 阅读 ( 2863 )
Ti Amo
vim显示行号、跳转到指定行或列
一、显示行号 命令模式输入 :set nu或:set number Tips：如果要设置每个打开的文件都默认显示行号，则使用vi编辑~/.vimrc文件或者/etc/vimrc文件，在该文件中加入一行set nu，保存并退出...
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- 星莓
- 发布于 2023-07-19 13:50
- 阅读 ( 2650 )
sort按科学计数法排序
在使用linux中的sort命令排序时，免不了有p值是科学计数法的情况 可以使用-g参数来对科学记数法的值进行排序，而且默认是从小到大排序。 以下是其他常用参数：
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- 星莓
- 发布于 2023-07-19 13:37
- 阅读 ( 1464 )
pip_search，pip search 的替代品
pip search 崩溃以后，各种payhon模块和软件的管理变得异常困难不过还是有一些不错的替代品的
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- xun
- 发布于 2023-07-10 10:00
- 阅读 ( 1050 )
xun
GATK报错| this implies a problem with the file locking support in your operating system
##### ERROR MESSAGE: Timeout of 30000 milliseconds was reached while trying to acquire a lock on file raw.vcf.tmp.idx. Since the GATK uses non-blocking lock acquisition calls that...
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- rzx
- 发布于 2023-07-03 10:10
- 阅读 ( 1153 )
rzx
Seqtk | 一个快速处理FASTA和TASTQ文件的工具
Seqtk工具地址：https://github.com/lh3/seqtk Seqtk工具命令： 操作举例： 01. 将FASTQ格式文件转换成FASTA格式； seqtk seq -a in.fq.gz > out.fa 02. 将FASTQ（Illumina 1.3+）格式...
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- rzx
- 发布于 2023-06-26 14:20
- 阅读 ( 3598 )
Rush：一款强大的Linux并行任务执行工具
Rush（Rapid Utilities SHell）是一款强大的并行任务执行工具，专门设计用于在Linux或Unix环境中进行批处理任务。该工具的设计初衷是为了使并行处理和任务管理变得更为简洁明了，同时具备灵活性...
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- xun
- 发布于 2023-06-20 14:15
- 阅读 ( 1734 )
提取 VCF 文件中的基因型信息
VCF 是一种常用的生物信息学文件格式，用于存储基因组中的遗传变异数据，特别是单核苷酸多态性（SNP）和小插入/缺失（Indel）等变异。 VCF 文件通常由文本格式组成，可以用文本编辑器进行查看...
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- 星莓
- 发布于 2023-06-15 15:59
- 阅读 ( 5501 )
csvtk，A powerful software for handling CSV files
CSVTK，即CSV工具包，是一个用于处理逗号分隔值（CSV）文件的实用命令行程序。由于其简单性、灵活性和效率，对于经常处理CSV文件的人来说，特别是在数据科学、生物信息学以及任何需要数据分析的...
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- xun
- 发布于 2023-06-08 09:54
- 阅读 ( 1109 )
