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bwa-mem2的用法

bwa-mem2（ https://github.com/bwa-mem2/bwa-mem2 ）

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  • 发布于 2023-01-11 13:07
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motif分析及meme的各项参数

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使用orthomcl分析同源基因时的 mysql数据库操作

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-26 14:48
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BWA比对及Samtools提取mapped reads

筛选出能比对到参考序列的reads，形成新的fastq文件

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-20 14:27
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GenomicsDBImport 的多样本变异检测

GenomicsDBImport 的多样本变异检测

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-19 10:59
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ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法

ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-12 14:49
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pfam数据库被合并之后，还有很多数据库可以进行结构域的查询

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pip报错

出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual envir...

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  • xun
  • 发布于 2022-12-05 16:42
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mysql启动时报错：error while loading shared libraries: libncurses.so.5: cannot open shared object file

mysql启动时报错

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-05 14:14
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MySQL报错：ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000)

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-05 14:09
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uniref50 数据库下载及格式化

uniref50 数据库下载及格式化

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-29 10:42
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singularity运行fastqc报错OutOfMemoryError

比如在singularity中运行： singularity exec /share/singularity_images/reseq_v1.2.sif fastqc $datadir/*.gz  -o $workdir/1.fastqc 可能报错： 可以加一个-t选项，多线程运行，如下图，...

Pheatmap绘制多分组热图

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名额有限-组学大讲堂共享云服务器开售了！

组学大讲堂云共享服务器上线！

duplicate_gene_classifier统计全基因组不同类型复制事件的数目

duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序，用于基因分类，统计全基因组不同类型复制事件的数目。 命令行格式： $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写，是Dl.blast文件。在运...

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  • rzx
  • 发布于 2022-11-16 14:00
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hmmer之hmmbuild用法

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Linux安装细胞器组装软件--GetOrganelle

GetOrganelle软件是一款由郁文斌老师开发的一套全新的细胞器基因组组装工具，可以对大规模的细胞器基因组进行快速、准确及自动化组装。

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  • 星莓
  • 发布于 2022-11-14 11:18
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Rocky 9下Rstudio-service配置教程

Rocky 9下Rstudio-service配置教程

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  • 安生水
  • 发布于 2022-11-08 14:28
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GATK4对于大量样品的项目进行变异检测

GATK4

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  • 发布于 2022-10-31 12:49
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GATK4进行变异检测是否可以多线程

GATK4

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  • 安生水
  • 发布于 2022-10-25 09:50
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