NCBI上传高通量测序数据到SRA数据库 aspera 支持续传
Aspera command line upload 数据，最只要的支持续传，如果数据量比较大的话建议用命令行的方法上传，不然，网页上传一旦断开，又得重新上传；
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- omicsgene
- 发布于 2018-08-30 20:03
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omicsgene
安生水
在线进化树美化网站-iTQL
除了利用Figtree等对进化树进行美化之外：两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！也有不少在线工具可以实现这项工作，譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后，选择Upload进入数据上...
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- Daitoue
- 发布于 2018-08-03 10:50
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Daitoue
Mapman对表达数据进行venn绘制
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下： 从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物...
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- Daitoue
- 发布于 2018-08-02 14:01
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Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护
Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-31 11:32
- 阅读 ( 4675 )
Mapman对表达数据进行聚类分析
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下： 从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物代谢通路注释+基因表达可视...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-27 10:17
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Muscle 进行多序列比对
MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件，在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候，大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-20 11:53
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在线版fimo程序做转录因子结合位点预测
meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点，这里介绍一下他的在线版用法。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-13 14:27
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dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline
之前在做dcaps标记，开始只找到网站版的软件，后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline
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- 安生水
- 发布于 2018-07-06 14:21
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搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）
搭建自己的生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）
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- omicsgene
- 发布于 2018-06-25 15:45
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GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据
自己没有数据，或者科研经费较少或者紧张，科研实验还要继续，利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-21 17:31
- 阅读 ( 9053 )
