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Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护
Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-31 11:32
- 阅读 ( 4432 )
Mapman对表达数据进行聚类分析
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下： 从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物代谢通路注释+基因表达可视...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-27 10:17
- 阅读 ( 5797 )
Daitoue
Muscle 进行多序列比对
MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件，在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候，大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-20 11:53
- 阅读 ( 8767 )
安生水
在线版fimo程序做转录因子结合位点预测
meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点，这里介绍一下他的在线版用法。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-13 14:27
- 阅读 ( 7397 )
dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline
之前在做dcaps标记，开始只找到网站版的软件，后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline
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- 安生水
- 发布于 2018-07-06 14:21
- 阅读 ( 6064 )
搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）
搭建自己的生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）
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- omicsgene
- 发布于 2018-06-25 15:45
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GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据
自己没有数据，或者科研经费较少或者紧张，科研实验还要继续，利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-21 17:31
- 阅读 ( 8770 )
生信老顽童
sci-hub文献下载网站
学术界的“盗版女王”，哈萨克斯坦研究生兼女黑客亚历山德拉·埃尔巴克彦。文末附可用链接，再也不用担心下载不到文章了。
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:26
- 阅读 ( 3353 )
轻松搞定fasta索引文件、序列提取
fasta是常用的序列存储格式，很多软件（如GATK、IGV等）在导入序列以及进行快速查找时通常需要建立索引文件。本文介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 11:05
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怎么做一张好看的分类学树状图
在做微生物多样性分析时，经常会接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn，用它生成的图会更好看哦！
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:55
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鉴定组装植物病毒——系统详尽的植物病毒学！
一本系统详尽讲述植物病毒的书-Plant Virology Protocols（文末有获取方式），堪称病毒学研究里程碑式巨制。主要内容是如何鉴定组装植物病毒！
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- 红橙子
- 发布于 2018-04-21 22:56
- 阅读 ( 3973 )
红橙子
