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python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

手把手教你多个基因组共线性作图。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-12 17:14
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MEGA构建进化树遇到报错信息

最近又有人遇到mega构建进化树时报错，所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 14:21
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endnote 如何插入书籍引用

endnote引用书籍的章节。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 13:43
  • 阅读 ( 34178 )

MCScanX 安装报错，支持64位系统

今天有学员问 MCScanX 安装问题，我试了下，果然有错误。 make报错： g++ struct.cc mcscan.cc read_data.cc out_utils.cc dagchainer.cc msa.cc permutation.cc -o MCScanX msa.cc: In fun...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-16 21:20
  • 阅读 ( 8126 )

分享一个破解版 endnote X7 文献管理软件 带中文界面

分享endnote文献管理工具

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-09 18:46
  • 阅读 ( 3260 )

pfam上不去 打开后搜索没有反应

pfam打开不了解决办法，Pfam这个主页里，这些搜索项目点击没有反应，是咋回事呢

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-09 08:33
  • 阅读 ( 7646 )

两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！

使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行，所以使用前记得要安装JAVA。  第一步：选择合适的树形 使用File – open 打开树文件（一般为.nwk文件），在左上方绿色...

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  • landy
  • 发布于 2018-04-22 18:38
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PubMed文献按影响因子排序

PubMed 按影响因子过滤文献

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:45
  • 阅读 ( 22643 )

外源插入位置查找好方法

简单高效的查找外源基因插入位置的方法，并可以设计共显性标记，方便后续实验验证。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:32
  • 阅读 ( 5360 )

PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc

通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-09-30 13:50
  • 阅读 ( 314 )

在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍： Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。 下载链接：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式： 1. 点...

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  • rzx
  • 发布于 2024-03-19 17:01
  • 阅读 ( 1455 )

cytoscape安装报错：No JVM could be found on your system

cytoscape安装报错：No JVM could be found on your system，通常是由于不适配的java版本

Orthofinder-构建物种系统发育树(Phylogenetic tree)

在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍，这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树（Phylogenetic tree）。 在Orthofinder结果文件中有一...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-15 17:33
  • 阅读 ( 5027 )

linux使用ossutil下载阿里云数据

linux使用ossutil下载阿里云数据

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-31 16:30
  • 阅读 ( 2996 )

保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片

保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片

将fasta序列多行变单行——使用 awk 或 seqkit 或 python

fasta序列多行变单行

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-26 16:03
  • 阅读 ( 4541 )

win11/win10安装最新版本的docker

win11安装docker

seqkit序列处理神器的常用命令

seqkit是一个序列处理神器，有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令，详细内容如下

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  • 星莓
  • 发布于 2022-11-18 17:22
  • 阅读 ( 4973 )

GEMMA软件下载安装

GEMMA软件下载安装

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  • 安生水
  • 发布于 2021-11-12 15:07
  • 阅读 ( 4185 )

启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库！

基因结构有很多概念，经常会把我们绕晕，之前小编给大家整理过mRNA、CDS、ORF等概念知识（感兴趣的点击查看：CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清）；今天我们再补充一些概念性知识及着重说下启动子以...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-09-07 09:16
  • 阅读 ( 14080 )