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  • rzx
  • 发布于 2024-08-01 11:34
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蛋白质组学数据定量搜库 | MaxQuant软件的使用

简介: MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一,免费使用,目前认可度相对较高,可针对多种质谱数据格式(.raw、.wiff、.mzML、.mzxml)。且内置了自己的肽段搜索引擎-...

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  • rzx
  • 发布于 2024-06-26 11:52
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一行代码检查GWAS分析中表型数据的错误

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  • 星莓
  • 发布于 2023-12-13 10:56
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screen软件快捷键修改

screen技巧

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  • xun
  • 发布于 2023-11-06 16:06
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使用NCBI——Batch Entrez批量下载蛋白序列

使用NCBI自带的工具实现蛋白序列的批量下载

blastn使用方法及结果详解

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  • 星莓
  • 发布于 2023-09-20 15:19
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OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

Orthofinder是做直系同源基因分析时常用软件,除此之外,还可以使用OrthoMCL,今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图:     1.1 (a)将所有物种的...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-15 16:15
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从fasta基因组中提取反向互补序列

从fasta基因组中提取反向互补序列,借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件     -bed 基因位置 共6列:【染色...

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  • rzx
  • 发布于 2023-02-27 14:22
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叶绿体基因组四个区边界作图——irscope:本地化及使用教程(2023.02)

大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构,即由LSC、SSC以及一对IR区域构成,IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-02-15 15:53
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MISA(在线)注释叶绿体基因组SSR

SSR (Simple Sequence Repeat),即简单重复序列,是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,也称为微卫星序列或者串联重复。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-02-06 11:04
  • 阅读 ( 3114 )

基于WSL2的docker更改存储位置

基于WSL2的docker更改存储位置

interpro 查询结构域

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HMMER ——hmmsearch 用法,参数

HMMER ——hmmsearch 用法,参数

notepad++显示所有字符(隐藏的回车换行空格)转换CRLF

notepad++显示所有字符(隐藏的回车换行空格)转换CRLF

关于CodeML分析中Branch-Site模型假设

branch-site models 类似于branch model和site model的合集,主要假设基因的不同位点间(site)和系统发育树的不同分支间(branch)的ω值均是变化的,目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...

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  • rzx
  • 发布于 2022-10-10 17:12
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在线绘制基因染色体位置图

在线绘制基因染色体位置图

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  • 安生水
  • 发布于 2021-11-12 15:30
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ICGC数据库的数据下载

下载ICGC数据库中的数据

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  • fangs
  • 发布于 2021-11-05 15:40
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blast+命令选择

blast+命令选择

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  • 安生水
  • 发布于 2021-09-10 13:37
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科研人汇报必备神器-屏幕标注软件!值得拥有!免费领!

科研人做汇报是少不了的,在汇报的时候为了强调ppt上的重点内容经常添加一些动作或者图形标记如箭头、圆圈等。今天小编给大家介绍一款能在汇报时可在屏幕上实时自由标记、突出重点内容的屏幕注...

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  • 红橙子
  • 发布于 2021-04-26 18:33
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蛋白质比对软件 blastp psi-blast phi-blast

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-04-20 16:25
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