软件工具 - 推荐的文章 - 第5页 - 组学大讲堂问答社区

使用NCBI——Batch Entrez批量下载蛋白序列

使用NCBI自带的工具实现蛋白序列的批量下载

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每天学习一点点
发布于 2023-11-01 13:53
阅读 ( 8721 )

OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

Orthofinder是做直系同源基因分析时常用软件，除此之外，还可以使用OrthoMCL，今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图： 1.1 （a）将所有物种的...

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rzx
发布于 2023-06-15 16:15
阅读 ( 4114 )

Minimap2安装与使用

minimap2是生信大牛Heng Li在2018年发表的三代序列比对工具。与传统的bwa相比，Minimap2可以用于三代测序，也支持 splicing awared 比对；与一些传统三代比对工具相比，Minimap2 速度非常快，...

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星莓
发布于 2023-05-12 11:07
阅读 ( 8683 )

从fasta基因组中提取反向互补序列

从fasta基因组中提取反向互补序列，借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件 -bed 基因位置共6列：【染色...

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rzx
发布于 2023-02-27 14:22
阅读 ( 1678 )

基于WSL2的docker更改存储位置

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生信阿姨
发布于 2023-01-30 14:19
阅读 ( 2428 )

interpro 查询结构域

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生信阿姨
发布于 2022-12-01 13:14
阅读 ( 3837 )

HMMER ——hmmsearch 用法，参数

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生信阿姨
发布于 2022-10-31 15:11
阅读 ( 4951 )

notepad++显示所有字符（隐藏的回车换行空格）转换CRLF

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生信阿姨
发布于 2022-10-19 09:42
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关于CodeML分析中Branch-Site模型假设

branch-site models 类似于branch model和site model的合集，主要假设基因的不同位点间（site）和系统发育树的不同分支间（branch）的ω值均是变化的，目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...

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rzx
发布于 2022-10-10 17:12
阅读 ( 2339 )

在线绘制基因染色体位置图

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安生水
发布于 2021-11-12 15:30
阅读 ( 7575 )

ICGC数据库的数据下载

下载ICGC数据库中的数据

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fangs
发布于 2021-11-05 15:40
阅读 ( 4894 )

blast+命令选择

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安生水
发布于 2021-09-10 13:37
阅读 ( 2049 )

科研人汇报必备神器-屏幕标注软件！值得拥有！免费领！

科研人做汇报是少不了的，在汇报的时候为了强调ppt上的重点内容经常添加一些动作或者图形标记如箭头、圆圈等。今天小编给大家介绍一款能在汇报时可在屏幕上实时自由标记、突出重点内容的屏幕注...

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红橙子
发布于 2021-04-26 18:33
阅读 ( 2619 )

mirDeep2的使用

miRNA的鉴定:利用miRDeep2软件进行已知及新（保守及非保守）的miRNA鉴定。miRDeep2会在reads比对到基因组上的位置两端分别延伸75、15bp进行结构预测。

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Morii
发布于 2021-01-08 16:38
阅读 ( 4729 )

MEGA下载

MEGA作为一款进化树软件，用于分析来自物种和种群的DNA和蛋白质序列数据，可用于序列比对、进化树推断、估计分子进化速度、验证进化假说等。

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Morii
发布于 2020-12-14 14:15
阅读 ( 2941 )

论文查重？给你推荐几个好用的网站！

论文怎么写出来的我不知道，但是发论文前查重都是必要的；查重犯难吗？来来来，小编给你捋一捋可靠查重网站！查重网站推荐 1. Turnitin Turnitin是世界上主流的学术不端检测系统之一，Turni...

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红橙子
发布于 2020-12-05 21:56
阅读 ( 2843 )

序列分析软件-DNAman使用介绍（二）

上一期给大家介绍了使用DNAman进行多重序列比对的方法，想了解的可以点击链接查看：多序列比对分析-Dnaman很好用！其实DNAman还有很多其他功能，今天我在和大家分享一下。 1. 绘制质粒图谱绘...

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红橙子
发布于 2020-09-07 09:24
阅读 ( 16403 )

win10系统docker 重装提示 Exising installation is up to date 解决方法

出现这个问题是因为卸载Docker没有卸载干净，导致无法重装解决方法：按下Window+R唤起命令输入界面，输入regedit 打开注册表编辑在地址栏输入HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Win...

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生信老顽童
发布于 2020-07-15 17:19
阅读 ( 6521 )

电脑双显示器如何配置？

这年头搞生物的不学点生信还真不行，没学生信之前，数据不会分析，更不会深入挖掘；自从掌握了生信技能，办公效率高了，文章产出多了，科研也不再那么枯燥乏味了！爱生信，拥抱向上的生活！子...

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红橙子
发布于 2020-02-19 17:06
阅读 ( 4323 )