安生水
每天学习一点点
htop查看程序的io占用
传统的top大家都用的很多,但是top里不会显示磁盘io,而在我们服务器里,磁盘高io往往才是程序运行的瓶颈 新版 的htop新增了io 的查看,读写过高对应选项会变成红色,方便我们查看,除此之外htop还有...
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- xun
- 发布于 2024-04-25 11:03
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xun
NCBI 基因组文件下载——datasets
datasets和dataformat是NCBI的命令行（Command line tools）工具，datasets可以下载ncbi上的生物数据，dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-04-24 16:52
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Ti Amo
转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo
转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo
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- 安生水
- 发布于 2024-04-01 11:36
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GATK 4.4.0报错“ A JNI error has occurred, please check your installation and try again”
报错 在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错： 报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。 出现报错的原因： 1. javac与java版本...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-03-25 11:54
- 阅读 ( 790 )
使用bcftools文件提取vcf文件子集
1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下： Chr1 11787600 11793521Chr1 30028805 30042382Chr1 54966087 54970283Chr1 57228272 ...
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- rzx
- 发布于 2024-03-11 18:13
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rzx
HISAT2比对时报错|(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)
我有12个样本在进行HISAT2比对时有3个样本出现报错(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) 运行脚本： hisat2 -p 10 --rg-id=L2 --rg SM:L2 --rg LB:L2 --rg PL:ILLUMINA -x iwgsc_re...
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- rzx
- 发布于 2024-03-07 10:12
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vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题
fa最新版vscode登录时会报错,因为一些系统基础软件版本太低了,所以如果不想回退版本,就需要更新一下 ▶ ldd --version #来看一眼自己的glibc版本 ldd (GNU libc) 2.37 Copyright (C) 2023...
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- xun
- 发布于 2024-02-02 14:24
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lnd无法下载样本名称含有+的数据
linuxnd linuxnd是linux系统下载诺禾致源测序数据的软件，其基础功能如list、cp、cp -d 已经在这篇文章中给大家列出： https://www.omicsclass.com/article/2084 错误的产生 该软件在遇到...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-01-31 10:52
- 阅读 ( 827 )
超快的文件传输软件trzsz
对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...
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- xun
- 发布于 2024-01-09 10:56
- 阅读 ( 922 )
