植物科学常用数据库和生物信息学工具

植物科学常用数据库和生物信息学工具

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-04-06 17:35
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blast比对软件使用

BLAST比对原理就是基于序列的相似性,推断该序列的同源基因,又根据同源基因具有相同功能,从而达到功能注释的目的,这个方法往往是有效的。尽管方法会误判(假阳性)或漏判(假阴性),但目前还没有能替代相似性推断同源性的方法,只能通过设置合理的阈值,尽量减少假阳性和假阴性的发生。但相似性并不能证明同源性。

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  • Morii
  • 发布于 2021-02-22 14:29
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mirDeep2的使用

miRNA的鉴定:利用miRDeep2软件进行已知及新(保守及非保守)的miRNA鉴定。miRDeep2会在reads比对到基因组上的位置两端分别延伸75、15bp进行结构预测。

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  • Morii
  • 发布于 2021-01-08 16:38
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文献图片检索工具-Openi,用图片检索文献!

有没有这个时候,很需要某一个科研图片做参考,从文献查起找到该图真如大海捞针;有没这个时候,记得某张图片,想查看原文,却想不起文献的题目,怎么也找不到。以上烦恼今天都一网打尽,给大家...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-12-18 12:15
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STAR比对软件的使用

相对其他比对软件而言,STAR的比对速度极快,如果有足够的内存(至少需要30G),就可以用STAR来分析。

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  • Morii
  • 发布于 2020-12-17 10:54
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MEGA下载

MEGA作为一款进化树软件,用于分析来自物种和种群的DNA和蛋白质序列数据,可用于序列比对、进化树推断、估计分子进化速度、验证进化假说等。

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  • Morii
  • 发布于 2020-12-14 14:15
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论文查重?给你推荐几个好用的网站!

论文怎么写出来的我不知道,但是发论文前查重都是必要的;查重犯难吗?来来来,小编给你捋一捋可靠查重网站! 查重网站推荐 1. Turnitin Turnitin是世界上主流的学术不端检测系统之一,Turni...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-12-05 21:56
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论文重复部分如何自动修改?!

论文查重是科研活动中重要一环,不重视搞不好就可能被定性抄袭或者学术不端,前期给大家分享过好用的几个论文查重网站,感兴趣的可以点击此链接查看:论文查重?给你推荐几个好用的网站!;其中...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-12-05 21:39
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STAMP使用(组间差异)

用FAPROTAX数据库注释得到的功能表,可以在STAMP内进行组间差异分析,且软件绘制出的图片精美,可直接用于文章发表。 一.STAMP软件简介 1.STAMP软件是分析微生物物种与功能组成的可视化软件,...

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  • Morii
  • 发布于 2020-10-14 11:45
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序列分析软件-DNAman使用介绍(二)

上一期给大家介绍了使用DNAman进行多重序列比对的方法,想了解的可以点击链接查看:多序列比对分析-Dnaman很好用!其实DNAman还有很多其他功能,今天我在和大家分享一下。 1. 绘制质粒图谱 绘...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-09-07 09:24
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启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库!

基因结构有很多概念,经常会把我们绕晕,之前小编给大家整理过mRNA、CDS、ORF等概念知识(感兴趣的点击查看:CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清);今天我们再补充一些概念性知识及着重说下启动子以...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-09-07 09:16
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蛋白互作网络分析可视化文件修改升级 支持 PDF导出

蛋白互作网络分析可视化文件修改升级,增加svg导出。

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  • 安生水
  • 发布于 2020-08-04 13:34
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GSDS网站docker镜像本地构建

GSDS网站docker镜像本地构建

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  • omicsgene
  • 发布于 2020-07-26 23:16
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一键显示影响因子与分区

大家在搜索查看英文文献的时候,如果想知道期刊的影响因子和分区,那么就需要二次搜索。多了一步搜索,就稍显繁琐。今天小编给大家介绍一款可以自动加载期刊影响因子和分区的插件(Scholarscope...

win10装docker desktop提示Installation failed: Containers Windows Feature is not available

在装docker的过程中如有以下报错 解决方法:新建containers.cmd,编辑内容如下,以管理员身份运行,执行完后按照提示重启电脑 pushd "%~dp0"dir /b %SystemRoot%\servicing\Packages\*conta...

win10系统docker 重装提示 Exising installation is up to date 解决方法

出现这个问题是因为卸载Docker没有卸载干净,导致无法重装 解决方法: 按下Window+R唤起命令输入界面,输入regedit 打开注册表编辑在地址栏输入HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Win...

IGV可视化使用

如何使用IGV来查看录组测序Reads与参考基因组序列比对结果,物种参考基因组序列和注释文件

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  • Morii
  • 发布于 2020-07-13 11:36
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一个助你快速阅读英文文献的小插件

前段时间小编给大家介绍了一款一键下载文献的小插件(Sci-hub button),用过的朋友都说好。但是把文献下载下来不是最终目的,读懂才是硬道理。想读懂英文文献,如果没有深厚的英语功底,那么只...

送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大,操作简单!

APE是一款序列分析软件,可以对序列进行酶切位点预测、序列比对、引物设计、DNA序列翻译等等,用途是十分广泛,APE软件小巧快速,操作简单,下面我们一起了解一下它的功能! 1. 酶切位点预测...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-06-29 11:58
  • 阅读 ( 15388 )

一文教你使用Excel画GO富集分析图

你会画GO富集分析图么?你知道用哪些数据来画么?这里有详细教程。