筛选VCF中指定位置变异位点

筛选VCF中指定位置变异位点

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-10 14:25
  • 阅读 ( 7262 )

GFF与GTF格式转换

GFF与GTF格式转换

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-10 11:53
  • 阅读 ( 9836 )

教你在线绘制circos图-简单!

相信大家都听说过circos图,但是亲自画过的人可能就很少,这主要因为软件的安装和使用稍微有一点麻烦。其实,circos图也是可以在线绘制的,这样就简单多了!一起来了解一下吧!

  • 4
  • 1
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-09 17:15
  • 阅读 ( 15825 )

eclipse当中出现中文乱码解决办法 UTF-8

eclipse当中出现中文乱码解决办法

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-03 15:20
  • 阅读 ( 2910 )

在线进化树美化网站-iTQL

除了利用Figtree等对进化树进行美化之外:两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图!也有不少在线工具可以实现这项工作,譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后,选择Upload进入数据上...

  • 5
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-03 10:50
  • 阅读 ( 15479 )

Mapman对表达数据进行venn绘制

Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物...

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-02 14:01
  • 阅读 ( 3795 )

cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

  • 3
  • 2
  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-01 18:50
  • 阅读 ( 288678 )

NCBI数据库当中下载基因组序列,cds序列,蛋白质序列等

NCBI下载物种基因组的信息

  • 5
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-01 10:30
  • 阅读 ( 16351 )

dell 服务器R430硬盘移除报错

dell服务器R430硬盘点击阵列卡

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-31 13:40
  • 阅读 ( 3010 )

Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护

Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-31 11:32
  • 阅读 ( 4550 )

Mapman对表达数据进行聚类分析

Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物代谢通路注释+基因表达可视...

  • 2
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-27 10:17
  • 阅读 ( 5904 )

做韦恩图?自己搞定!

韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具,简单易学!

  • 2
  • 3
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-26 11:08
  • 阅读 ( 27367 )

利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域

搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!

  • 5
  • 6
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-23 12:11
  • 阅读 ( 77082 )

Muscle 进行多序列比对

MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。

  • 1
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:53
  • 阅读 ( 8937 )

blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。

  • 2
  • 4
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:13
  • 阅读 ( 21150 )

植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

你可以对基因进行功能注释,分析其功能分类以及相关的通路信息,你也能分析基因的表达谱数据,但是你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做...

  • 7
  • 1
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-20 09:18
  • 阅读 ( 14703 )

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop,用好了这两个软件也会使你的文章配图增色不少,甚至事半功倍。

  • 0
  • 2
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-19 11:47
  • 阅读 ( 8723 )

java 安装以及环境变量配置

配置JAVA环境,运行java程序

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-18 22:38
  • 阅读 ( 12717 )

在线版fimo程序做转录因子结合位点预测

meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点,这里介绍一下他的在线版用法。

  • 2
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 14:27
  • 阅读 ( 7679 )

python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

手把手教你多个基因组共线性作图。

  • 5
  • 3
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-12 17:14
  • 阅读 ( 27021 )