blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:13
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植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

你可以对基因进行功能注释,分析其功能分类以及相关的通路信息,你也能分析基因的表达谱数据,但是你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-20 09:18
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科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop,用好了这两个软件也会使你的文章配图增色不少,甚至事半功倍。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-19 11:47
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java 安装以及环境变量配置

配置JAVA环境,运行java程序

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-18 22:38
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在线版fimo程序做转录因子结合位点预测

meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点,这里介绍一下他的在线版用法。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 14:27
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python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

手把手教你多个基因组共线性作图。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-12 17:14
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GOrilla-一个在线GO富集分析的网站

在线GO富集分析

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-11 10:38
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MCScanX 在biolinux上安装及使用

MCScan安装与共线性分析练习

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 13:58
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blast报错

在刚开始按官网教程(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279680/)学习使用blast时,经常会遇到程序报错

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 15:00
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BLAST+使用方法

BLAST+是使用非常广泛的序列比对软件,有NCBI提供

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:36
  • 阅读 ( 6427 )

dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

之前在做dcaps标记,开始只找到网站版的软件,后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:21
  • 阅读 ( 5878 )

小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 09:07
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DNA SequenceLogo

快速绘制DNA Logo

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:39
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你了解SAM和BAM文件吗

当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后,会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件!

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 09:33
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endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

endnote 文献插入出现大括号,不自动更新解决办法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-27 17:53
  • 阅读 ( 33096 )

搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R(java环境)

搭建自己的生信编程环境eclipse+perl+python+R(java环境)

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-25 15:45
  • 阅读 ( 4942 )

MEGA构建进化树遇到报错信息

最近又有人遇到mega构建进化树时报错,所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 14:21
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endnote 如何插入书籍引用

endnote引用书籍的章节。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 13:43
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GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

自己没有数据,或者科研经费较少或者紧张,科研实验还要继续,利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:31
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GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

GEO2R是GEO在线分析工具,基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:19
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