Excel数据分析技巧之方差分析

做方差分析，用Excel，简单、快捷、方便，你值得拥有！

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• 生信老顽童
• 发布于 2018-06-20 10:30
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Excel数据分析技巧之双因素方差分析

>>方差分析之双因素方差分析 小编在节前做过一期使用excel表进行单因素方差分析的推送，反响不错，小编也颇受鼓舞！但是，在许多情况下，单因素方差分析已经不能满足实际分析的需要。比...

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• 生信老顽童
• 发布于 2018-06-20 10:29
• 阅读 ( 5488 )

如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧

PubMed文献搜索的一个实用技能--如何按照影响因子进行筛选文章？

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• 生信老顽童
• 发布于 2018-06-20 10:18
• 阅读 ( 18569 )

GSEA分析需要的文件及格式

在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候，需要四个文件： 1、基因表达数据文件； 2、表型数据文件； 3、功能基因集文件； 4、芯片注释文件； 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即...

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• landy
• 发布于 2018-06-14 15:11
• 阅读 ( 21039 )

绘制基因结构图软件GSDS使用过程中图片的修改问题

在使用GSSE绘制基因结构或者是顺势作用元件时，如果图例太多，在网页展示不出来，这个时候你需要对图片进行修改.增大背景画布就可以显示了，点击下图红色箭头所指按钮，进入到图片编辑界面: 拉...

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• landy
• 发布于 2018-06-14 14:48
• 阅读 ( 11057 )

一个预测基因保守结构域网站

今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站： 网址：http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列，点击submit，就开始运行，结果如下图所示： 这个网站不仅分析了蛋白的保...

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• landy
• 发布于 2018-06-08 18:06
• 阅读 ( 14000 )

pubmed按影响因子分类文献

pubmed按影响因子归类搜索文献

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• omicsgene
• 发布于 2018-05-20 10:06
• 阅读 ( 4199 )

提取bam/sam文件指定区域reads

若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads，可以使用samtools和bedtools来实现。  首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID，第二三列分别为起始终止位置               ...

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• 安生水
• 发布于 2018-05-18 09:34
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blast序列比对中E值是什么意思？

E value——E（Expect）值，表示随机匹配的可能性。E值越大，随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时，具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco...

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• landy
• 发布于 2018-05-17 10:45
• 阅读 ( 16669 )

MCScanX 安装报错，支持64位系统

今天有学员问 MCScanX 安装问题，我试了下，果然有错误。 make报错： g++ struct.cc mcscan.cc read_data.cc out_utils.cc dagchainer.cc msa.cc permutation.cc -o MCScanX msa.cc: In fun...

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• omicsgene
• 发布于 2018-05-16 21:20
• 阅读 ( 7907 )

如何快速获取多条序列长度信息

如何快速知道你的多个序列的长度呢？这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具，samtools。命令行格式：samtools faidx   xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件，也是就是在...

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• landy
• 发布于 2018-05-11 11:31
• 阅读 ( 3345 )

如何将基因组的注释文件gff转化成基因的注释文件gtf

在做分析的时候，有时候我们需要将gff文件转化为gtf，如何转化呢？ 这里有一个小工具，虚拟机的bio-linux自带不需要安装，就是gffread： 命令行格式：gffread   gff文件   -T  -o  gtf文件，...

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• landy
• 发布于 2018-05-11 10:55
• 阅读 ( 6007 )

分享一个破解版 endnote X7 文献管理软件 带中文界面

分享endnote文献管理工具

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• omicsgene
• 发布于 2018-05-09 18:46
• 阅读 ( 3138 )

pfam上不去 打开后搜索没有反应

pfam打开不了解决办法，Pfam这个主页里，这些搜索项目点击没有反应，是咋回事呢

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• omicsgene
• 发布于 2018-05-09 08:33
• 阅读 ( 7430 )

利用NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息

相近功能基因的检索方法，如何利用pfam数据库下载隐马尔科夫hmm文件。

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• landy
• 发布于 2018-04-23 14:05
• 阅读 ( 48566 )

群体遗传进化分析用MEGA

MEGA进行遗传进化分析，揭示不同种群间遗传进化关系和环境适应性机制。

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• Daitoue
• 发布于 2018-04-23 09:39
• 阅读 ( 14327 )

获取MOTIF 位置信息矢量图

MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解，是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具，结果输出一般是有四个文件，motif的图形展示文件（LOGO），txt文本，html的网页信息文件及xml...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 21:05
• 阅读 ( 15773 )

一键搞定批量序列提取TBtools！

用基因ID提取其序列很简单，ctrl+F找到ID对应的序列，ctrl+C、ctrl+V就好了，少量基因的还OK，但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽？ 这里墙裂推荐一个软件，功能很强大，就是TBtoo...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 19:08
• 阅读 ( 30371 )

分分钟教你绘制基因结构图！GSDS

今天介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server，简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构，清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 18:59
• 阅读 ( 62994 )

两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！

使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行，所以使用前记得要安装JAVA。  第一步：选择合适的树形 使用File – open 打开树文件（一般为.nwk文件），在左上方绿色...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 18:38
• 阅读 ( 28314 )