duplicate_gene_classifier统计全基因组不同类型复制事件的数目
duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序，用于基因分类，统计全基因组不同类型复制事件的数目。 命令行格式： $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写，是Dl.blast文件。在运...
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- rzx
- 发布于 2022-11-16 14:00
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rzx
生信阿姨
Linux安装细胞器组装软件--GetOrganelle
GetOrganelle软件是一款由郁文斌老师开发的一套全新的细胞器基因组组装工具，可以对大规模的细胞器基因组进行快速、准确及自动化组装。
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- 星莓
- 发布于 2022-11-14 11:18
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星莓
安生水
notepad++显示所有字符（隐藏的回车换行空格）转换CRLF
notepad++显示所有字符（隐藏的回车换行空格）转换CRLF
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- 生信阿姨
- 发布于 2022-10-19 09:42
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进化树美化操作详解- iTOL
绘制进化树，是科研人的基础技能之一，而一张好看的进化树图，不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系，更能增加文章的观赏性，赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...
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- rzx
- 发布于 2022-10-12 15:53
- 阅读 ( 20793 )
关于CodeML分析中Branch-Site模型假设
branch-site models 类似于branch model和site model的合集，主要假设基因的不同位点间（site）和系统发育树的不同分支间（branch）的ω值均是变化的，目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...
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- rzx
- 发布于 2022-10-10 17:12
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关于CodeML分析中四种常见模型假设
codeml是PAML软件包下的一个程序，在估算蛋白编码序列同义替换和非同义替换速率以及检测序列是否经受正选择分析中受到广泛应用。 对于一棵系统发育进化树，在考虑其不同序列间（site）和不同支...
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- rzx
- 发布于 2022-10-10 15:41
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Clustal Omega多序列比对使用方法（命令行及在线网站）
Clustal Omega是欧洲生物信息研究所（EBI）开发的多序列比对排列工具，现已经完全取代了之前ClustalW的地位。最新本的omega比对准确度更高，而且速度更快，适合大规模的多序列比对。
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- 星莓
- 发布于 2022-09-09 14:21
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itol添加圆环分组和节点标签时位置调整
在进行iTOL绘制进化树时，需要导入分组圆环或者节点标签的配置文件。最后选择了单个文件上传，在调整好上一圈标签的位置后再导入下一个文件，这样就不会相互影响了。
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- rzx
- 发布于 2022-09-05 11:39
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下载和安装软件遇到问题：下载：Microsoft Edge通常不会下载请在打开前确保信任，安装:Microsoft Defender SmartScreen 阻止了无法识别的应用启动,存在风险。以TBtools举例
解决办法如下 Microsoft Defender Smartscreen 关掉即可下载 接下来是安装 如果遇到Microsoft Defender SmartScreen 阻止了无法识别的应用启动。运行此应用可能会导致你的电脑存在风险。...
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- 生信阿姨
- 发布于 2022-08-26 10:03
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0.1元学习《Docker在Linux系统中安装与使用》
docker作为一个虚拟化工具，可以让我们直接使用镜像里面的生信分析软件分析我们的数据，省去安装linux软件的麻烦，对于初学linux的学员非常有用。 我们的《Docker生物信息工具安装与使用》课程...
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- 生信老顽童
- 发布于 2022-08-19 11:59
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生信老顽童
