使用NCBI自带的工具实现蛋白序列的批量下载
在基因家族分析中,有时候我们会想要知道我们所关注的基因家族在不同物种基因组间的同源性情况,或者只是简单的想要了解物种间染色体的进化关系,这时候就需要进行物种间全基因组的共线性分析,然后根据共线性分析结果进行可视化。今天我们就来教大家使用一款常用的共线性分析和可视化软件——MCscan,进行多物种的基因组共线性绘图。
重组蛋白的纯化是生物学研究中的重要技术。为了研究蛋白的特定功能和结构,研究人员必须将重组蛋白从生物体中分离并纯化。蛋白纯化方法主要利用不同重组蛋白之间的相似性和差异性。可以根据蛋白之间的相似性去除非蛋白物质,然后根据蛋白之间的差异分离纯化目标重组蛋白。在蛋白纯化的过程中,我们可能会遇到一些问题。让我们一起来看看这些问题,并探讨相应的解决方案吧!
新的一年已经开始,正所谓春耕秋收,春天正是积累的季节,对科研人员来说选对学习的方向才能收获丰硕的成果。后基因组时代,生物科研圈最大的矛盾是:与日俱增的数据量和科研人员处理数据的能力...
在生信分析时,经常会做一下蛋白多序列比对。对于比对结果中,一些不保守的列,我们可以选择剪切掉。再进行之后的分析,比如构建进化树,进化树的构建会容易很多。 剪切序列时有一个非常好用的...
REPuter可注释叶绿体重复序列,包括4种类型,Forward(F), Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPuter 是可在线注释, 详情可参考文献 REPuter: the manifold applications of...
泛基因组视频课程介绍
1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下: Chr1 11787600 11793521Chr1 30028805 30042382Chr1 54966087 54970283Chr1 57228272 ...
代谢组数据上传NGDC!简单又快捷!
谷胱甘肽-S-转移酶(GST)是一个由211个氨基酸组成的大小为26kDa序列,它是另一种广泛使用的可提高靶蛋白的溶解度亲和标签。GST标签与固定化的谷胱甘肽具有亲和力,常用于原核表达。它可以与一个蛋白的N端或C端融合。 谷胱甘肽亲和是一种有效的一步纯化GST(谷胱甘肽S-转移酶)标签蛋白的方法。GST可作为一种可溶性蛋白在大肠杆菌细胞质中大量表达,并具有完全的酶活性。此外,许多在大肠杆菌中表达时不溶的真核蛋白,在表达为GST标签蛋白时被证明至少部分可溶。
CandiHap是一款应用于全基因组关联分析(GWAS)后,快速分析基因单倍型来鉴定候选基因的一款友好软件。研究者可通过该软件对单个基因,或者对GWAS显著关联位点LD范围内所有基因进行单倍型分析,发现与性状显著关联的单倍型和候选基因。
基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...
转录组个性化分析之可变剪切分析工具:rMATS turbo
简介: MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一,免费使用,目前认可度相对较高,可针对多种质谱数据格式(.raw、.wiff、.mzML、.mzxml)。且内置了自己的肽段搜索引擎-...
gatk报错 An index is required but was not found for file drivingVariantFile。 bcftools报错 index: the file is not BGZF compressed, cannot index
PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析
义翘神州提供三大跨膜蛋白制备平台,有VLP技术平台、去垢剂技术平台、Nanodisc技术平台。