老师您好，请问在群体遗传进化中，模板数据黄瓜的分组，sample 是指的什么？是测序数据下机的样品编号？
不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件，后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt？
- 0
- 0
- shidandan
- 发布于 2023-11-02 09:41
- 阅读 ( 621 )
shidandan
xun
基于 gff 文件构建 TxDb 包
TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...
- 0
- 0
- 安生水
- 发布于 2024-05-15 16:45
- 阅读 ( 615 )
安生水
批量下载多个链接的文件
对象存储（Cloud Object Storage，COS）是由腾讯云推出的无目录层次结构、无数据格式限制，可容纳海量数据且支持 HTTP/HTTPS 协议访问的分布式存储服务，具有高扩展性、低成本、可靠安全等优点...
- 0
- 0
- Ti Amo
- 发布于 2024-02-21 14:00
- 阅读 ( 613 )
Ti Amo
omicsgene
对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包
- 0
- 0
- 每天学习一点点
- 发布于 2024-07-05 14:39
- 阅读 ( 608 )
每天学习一点点
Linux重定向以及nohup不输出的方法
在Linux中，0、1和2分别代表标准输入（stdin）、标准输出（stdout）和标准错误输出（stderr）
- 0
- 0
- 每天学习一点点
- 发布于 2024-03-13 11:49
- 阅读 ( 597 )
R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
- 0
- 0
- omicsgene
- 发布于 2024-04-16 15:38
- 阅读 ( 596 )
给进化树标定化石时间
进化树（Phylogenetic Tree）是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中，每个分支点（节点）代表一个共同祖先，而每个末端的分支（叶节点）代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间，即在进化树上标注时间点，为进化树提供了一个时间框架，便于超度量树的构建
- 0
- 0
- Ti Amo
- 发布于 2024-07-10 17:43
- 阅读 ( 594 )
好用的perl模块推荐
Path::Tiny 是一个专注于简洁性和便利性的 Perl 模块，用于处理文件和目录操作。以下是 Path::Tiny 的一些主要功能 1，目录相关 在perl 里很多人会使用 mkdir path unless(-d path); 来创建...
- 0
- 0
- xun
- 发布于 2023-12-07 16:16
- 阅读 ( 588 )
运行Linux版本ProteoWizard中的chainsaw工具时报错
chainsaw工具，用于预测蛋白序列的酶切结果 运行命令： chainsaw test.fasta 报错： locale::facet::_S_create_c_locale name not valid 解决： 在当前环境中运行命令 export LC_ALL=C;...
- 0
- 0
- rzx
- 发布于 2023-09-27 15:02
- 阅读 ( 586 )
rzx
Python模块导入的 路径索引
在使用python的时候经常需要调用库及module，有的时候分明已经import了，在运行的时候却收到 ModuleNotFoundError的报错。那么Python到底是从哪里、以什么样的顺序调用的呢？ 在Python中有内建...
- 0
- 0
- Ti Amo
- 发布于 2023-12-05 10:17
- 阅读 ( 572 )
星莓
