R语言基础入门—数据结构(1)
报错: 运行HiC-Pro的时候出现报错: 去看log文件发现: 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找: 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件,看一...
“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...
甲基化水平计算
R语言基础入门—数据结构(2)
10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...
在Linux系统中,grep(Global Regular Expression Print)是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行,并将其打印出来。今天,我们结合以下...
基因展示图时如何设置细胞排布顺序
scanpy 中 ScTransform分析:
准备eQTL分析的协变量文件
expression()函数是没办法同时代入公式和变量,这个时候我们可以使用另一个函数来替代——bquote()
seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除
介绍如何修改已经load的镜像的镜像名/版本号
“ 2024年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Trait-based study predicts glycerol/diol dehydratases as a key function of the gut microbiota of hindgut-fermenting carnivores(Saccha...
R 安装github包报错:
我们在挂载ntfs格式的硬盘的时候,一般可以正常使用linux命令,不会有啥问题,但是如果硬盘格式是exFAT,会发现有很多问题,比如权限不能改 如何判断自己的硬盘的格式?比如位置在/dev/sdb2,用以下代...
“ 2024年8月《BMC Plant Biology》发表了一篇题为“SOS1 gene family in mangrove (Kandelia obovata): Genome-wide identification, characterization, and expression analyses under salt and...
如果是非数字形式的染色体编号(尤其是其中有特殊字符),annovar的注释可能会有问题,需要改成数字格式
在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法: 1. vim 打开二进制文件: vim -b 文件 将内容转换成16进制: :%!xxd 转换回来: :%!xxd -r 2. iconv # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...
ImportError: pycurl: libcurl link-time ssl backend (nss) is different from compile-time ssl backend (none/other)