全部 - 热门的文章 - 第12页 - 组学大讲堂问答社区

bcftools创建vcf索引失败

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安生水
发布于 2024-03-18 13:44
阅读 ( 458 )

遗传图谱构建基础知识

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omicsgene
发布于 2024-03-04 14:48
阅读 ( 453 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)

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omicsgene
发布于 2024-06-27 13:48
阅读 ( 434 )

GenePred格式

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安生水
发布于 2024-06-11 15:46
阅读 ( 423 )

add a Convex Hull with module

有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...

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xun
发布于 2024-07-11 09:20
阅读 ( 422 )

空间转录组数据预处理

空间转录组简介空间转录组，顾名思义，是在转录组的基础上加上了空间位置信息。如果不借助空间的技术,我们的转录组一般是粉碎组织到细胞层级或者更低的rna碎片层级,而进行sc RNA或者Bulk...

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xun
发布于 2024-07-02 15:56
阅读 ( 420 )

VScode文档列对齐插件-code alignment

一款VScode中文档列对齐的插件

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每天学习一点点
发布于 2024-05-29 11:56
阅读 ( 404 )

惊喜价！转录组299元/个

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生信老顽童
发布于 2024-05-08 09:07
阅读 ( 398 )

使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

在做eQTL分析时需要提供隐藏因子作为分析的部分协变量，分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素，例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等，这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的，但是会影响基因表达的因素)，需要进行预先处理。

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每天学习一点点
发布于 2024-06-19 15:39
阅读 ( 386 )

gtfToGenePred报错

使用gtfToGenePred的命令和报错： gtfToGenePred -genePredExt Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...

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Ti Amo
发布于 2024-06-13 11:47
阅读 ( 385 )

RunUMAP函数报错,

执行降维分析的函数,umpa的时候报错 brain <- RunUMAP(brain, reduction = "pca", dims = 1:30) 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) : function '...

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xun
发布于 2024-07-25 14:15
阅读 ( 383 )

R markdwon 代码块选项说明：

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omicsgene
发布于 2024-06-08 15:25
阅读 ( 382 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

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omicsgene
发布于 2024-06-27 14:03
阅读 ( 370 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌（GSE123813）

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omicsgene
发布于 2024-06-11 17:24
阅读 ( 368 )

快速整理shell里面用到的脚本；

shell

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omicsgene
发布于 2024-05-24 10:27
阅读 ( 368 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

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omicsgene
发布于 2024-06-27 13:33
阅读 ( 366 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌（NSCLC）(GSE127465)

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omicsgene
发布于 2024-07-24 11:11
阅读 ( 362 )

sed使用

在Linux系统中，sed（stream editor）命令是一个非常强大的文本处理工具。它主要用于对文本文件进行过滤和转换操作，支持非交互式的文本编辑。今天，我们就来深入了解一下sed命令的详细使用方法...

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Ti Amo
发布于 2024-05-20 15:38
阅读 ( 354 )

SCTransform ,Error: useNames = NA is defunct

SCTransform在seuratv4的时候没问题,升级到v5的时候不工作,出现报错 > brain <- SCTransform(rep, assay = "Spatial", verbose = TRUE)Running SCTransform on assay: SpatialRunning SC...