绘制全基因组甲基化图谱
解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题
单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)
Mac | Mac M 芯片应用意外退出问题
biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的 先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys l...
bowtie2 将fasta序列比对到参考基因组
B细胞分类:
单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
gdal 报错
单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌(HCC)(GSE149614)
“ 2024年6月Frontiers in immunology 杂志发表了一篇题为Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram mo...
eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包,专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入,以生成一系列图表,可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。
如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
非小细胞肺癌(GSE148071)
有时候我们需要从tar压缩文件夹中仅提取某个目标文件,如果对整个压缩文件进行解压的话,未免太占用空间和资源,我们可以使用如下命令进行操作
Linux命令处理文件合并
DockerHub镜像无法下载的解决方案
蛋白质比对结果快速分类taxid的c脚本
食管癌 10X多样本(GSE145370)