bam文件排序

通常进行SNP calling的之前我们需要对比对的bam文件进行排序、去重等工作,在这里介绍几种sort bam的方法。 1. 按照比对位置进行排序 sambamba比samtools快很多,samtools和sambamba默认按...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-12-27 11:05
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8月相约南京--群体遗传进化GWAS分析、T2T基因组、泛基因家族、宏基因组等主题培训!

组学大讲堂线下培训,助你暑期弯道超车,多门经典课程等你来学!

windows安装Aspera Connect软件

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  • 安生水
  • 发布于 2024-03-22 17:29
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探索基因大数据的利器——SRA Explorer

探索基因大数据的利器——SRA Explorer

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-08 15:19
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Rocky 9.1修改IP地址

Rocky 9.1修改IP地址

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  • 安生水
  • 发布于 2023-12-28 09:43
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QTL定位方法介绍

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-06-03 09:44
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MAFFT介绍

MAFFT简介 MAFFT是一种流行的多序列比对软件,广泛应用于生物信息学领域,特别是在系统发育分析和功能基因组学研究中。它通过采用快速傅里叶变换(FFT)来提高比对的速度和准确性,适用于大规...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-04 13:43
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NCBI 基因组文件下载——datasets

datasets和dataformat是NCBI的命令行(Command line tools)工具,datasets可以下载ncbi上的生物数据,dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-04-24 16:52
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在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍: Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件,由go语言编写,功能比较完善,软件使用也很稳定。 下载链接:https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式: 1. 点...

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  • rzx
  • 发布于 2024-03-19 17:01
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运行useradd -m us001 时报错:Creating mailbox file: File exists

运行useradd -m us001 时报错:Creating mailbox file: File exists

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  • 安生水
  • 发布于 2024-04-22 14:37
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如何预测CpG岛

在人类基因组的广袤海洋中,隐藏着许多生物学上重要的结构,其中之一就是CpG岛。这些富含CpG二核苷酸的DNA序列区域在基因表达调控中扮演着关键角色。然而,要想有效地理解这些岛屿的功能,首先...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-06-04 14:44
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无法访问zenodo

多个浏览器均无法访问zenodo网站 解决方法: 1. 找到ip:188.185.79.172 查询ip的网址:站长工具 - 站长之家 (chinaz.com) 2. 进入C:\WINDOWS\system32\drivers\etc,修改host权限 3、...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-02 15:58
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笔记本电脑本地连接以太网时如何手动设置IP?

一般情况下,我们笔记本在使用网线连接上网的时候,路由器会自动给你分配一个内网IP。这个IP也是不固定的。 有时候我们会突然遇到连接断网的情况。在排除硬件坏掉情况下,最大原因是自动分配的...

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  • rzx
  • 发布于 2024-02-26 18:01
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在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件

libpcre2-8.so.0是PCRE(Perl Compatible Regular Expressions)库的一个版本,通常用于支持正则表达式。

SNP 过滤标准保证数据质量及参考文献:

最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释,这里总结一下相关的参考文献和标准的出处

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-12 16:59
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火山云 | tos:// 数据下载 | windows/linux下载方式

01:windows | 通过 共享链接 登录 TOS Browser 软件(版本> v1.7.0)下载 01-1:在本地电脑下载TOS Browser 软件,安装包网址:https://www.volcengine.com/docs/6349/148777 01-2:双击...

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  • rzx
  • 发布于 2024-08-01 11:34
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R语言按列合并文件,并保持其中一个文件的原有顺序

1.join函数;2.创建新的顺序变量;3.inner_join函数

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  • 星莓
  • 发布于 2024-01-30 17:49
  • 阅读 ( 1579 )

利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-28 14:21
  • 阅读 ( 1575 )

rMATS turbo使用

rMATS turbo使用

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-17 11:30
  • 阅读 ( 1512 )

给进化树标定化石时间

进化树(Phylogenetic Tree)是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每个分支点(节点)代表一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-10 17:43
  • 阅读 ( 1473 )