基因组组装质量评估

大量基因组的公布为科研工作者提供了更多资源,组装指标的好坏直接影响着整个基因组的质量,而常用的N50指标并不能全方位展示整个基因组的质量,那么如何才能检验一个基因组组装结果的可靠性呢?

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-10-11 11:06
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探索基因大数据的利器——SRA Explorer

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-08 15:19
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快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

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  • 发布于 2023-11-08 10:29
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基因组重测序docker镜像更新到2.0

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  • 发布于 2023-10-16 10:12
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细胞焦亡、铁死亡及铜死亡等基因集

细胞焦亡、铁死亡及铜死亡浅析

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  • 发布于 2023-12-14 14:37
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特殊染色技术的原理及其在实践中的应用

HE染色,全称为苏木精-伊红染色法 (hematoxylin-eosin staining),是最基本的病理学染色技术,能够对正常组织和病理组织进行形态结构的观察。特殊染色是常规HE染色的必要补充,能够有针对性地对组织成分进行染色,使组织病理学评价更加完善精确,在临床病理学诊断和病理组织学研究具有重要的应用价值。除常规的HE染色外,义翘神州还提供9种特殊染色服务,包括masson三色染色、 PAS染色、尼氏染色、VG染色、苏丹黑染色、普鲁士蓝染色、油红O染色和β-半乳糖苷酶衰老染色等。

linux系统中docker镜像下载失败解决办法

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  • 发布于 2024-06-25 13:50
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蛋白表达的影响因素及规避方法?

细胞作为生命的基本单位,必须利用其DNA中编码的信息来制造蛋白,因为蛋白对细胞结构至关重要,可以使细胞具有特定的形状和结构。根据中心法则,当DNA转录为RNA,RNA又被翻译成蛋白时,遗传信息则从DNA传递到RNA再到蛋白。那么影响蛋白表达的因素有哪些?又如何规避呢?

实时定量PCR技术原理及标记方法详解

实时荧光定量PCR根据所使用的荧光标记方法可分为两种:荧光染料(SYBR Green I染料为主)和荧光探针(TaqMan探针)。

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在这个科研内卷的年代,你没有好设备,没有好材料,没有充足经费,怎么立足?毕业、就业、发文、评职称,靠什么来实现?留给你破局的选择不多!!为此,我们组学大讲堂决定干一票大的!我们将永...

小尺度的种群历史分析——∂a∂i原理解析

种群历史分析中我们最为关注的主要有以下三个方面:1.分化时间与顺序;2.种群大小;3.分化后群体之间的基因交流情况。通常我们会使用PSMC去进行种群历史变化的研究,但其更适用于百万年的大尺度分析,而2万年以内的变化则很难真实体现。 什么软件既能回答以上三个方面的问题,又不受时间尺度的局限呢?那就是∂a∂i!

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-09-26 11:21
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cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system

cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system,通常是由于不适配的java版本

《叶绿体基因组分析实操》课程更新

​叶绿体/质体是植物的重要细胞器,具有独立的基因组。自植物叶绿体基因组被发现以来,被广泛应用于植物系统进化关系研究、物种鉴定、叶绿体基因工程等方面。 同时叶绿体基因组分析作为一个优秀...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-10-12 15:42
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SURVIVOR合并单样品SV出错

在做SV、CNV变异检测时,会使用SURVIVOR将不用样品的vcf文件合并到一起,命令如下: ls *.max.vcf >sample_files && /share/work/biosoft/SURVIVOR/SURVIVOR/Debug/SURVIVOR merge...

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  • 安生水
  • 发布于 2023-12-13 13:51
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NCBI 数据下载

介绍如何在大型生物数据库NCBI上下载数据

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-12-18 11:25
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Windows里MaxQuant下载与安装

MaxQuant网址:https://www.maxquant.org/

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  • rzx
  • 发布于 2024-06-19 17:02
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R magick 包安装包错

R magick 包安装包错

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  • 发布于 2023-10-10 19:50
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MAFFT介绍

MAFFT简介 MAFFT是一种流行的多序列比对软件,广泛应用于生物信息学领域,特别是在系统发育分析和功能基因组学研究中。它通过采用快速傅里叶变换(FFT)来提高比对的速度和准确性,适用于大规...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-04 13:43
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运行useradd -m us001 时报错:Creating mailbox file: File exists

运行useradd -m us001 时报错:Creating mailbox file: File exists

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  • 安生水
  • 发布于 2024-04-22 14:37
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NCBI 基因组文件下载——datasets

datasets和dataformat是NCBI的命令行(Command line tools)工具,datasets可以下载ncbi上的生物数据,dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-04-24 16:52
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