omicsgene
Unicycler二代、三代混合组装
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- 星莓
- 发布于 2023-10-26 14:31
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星莓
Molecular Plant | 一个接近完整的拟南芥基因组组装
模式植物拟南芥的基因组很小，不超过150M，只有5对染色体，因此它也是最早实现全序列分析的植物，同时其基因组序列的测定极大地促进了植物分子生物学的研究。20多年后，拟南芥基因组TAIR10仍然...
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- Ti Amo
- 发布于 2023-10-12 16:26
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Ti Amo
笔记本电脑本地连接以太网时如何手动设置IP？
一般情况下，我们笔记本在使用网线连接上网的时候，路由器会自动给你分配一个内网IP。这个IP也是不固定的。 有时候我们会突然遇到连接断网的情况。在排除硬件坏掉情况下，最大原因是自动分配的...
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- rzx
- 发布于 2024-02-26 18:01
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rzx
Bowtie2使用方法与参数详细介绍
对参考序列构建indexbowtie2-build genome.fasta index尝试使用前10000个reads进行比对bowtie2 -u 10000 -p 8 -x index -1reads1.fq -2 reads2.fq -S out.sam使用8个线程进行比对bowtie2 -p 8...
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- rzx
- 发布于 2023-10-18 17:58
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生信老顽童
离子交换色谱步骤及作用
离子交换层析(IEX)是一种主要基于蛋白净电荷的色谱分离方法，通常用于追踪脱酰胺和琥珀酰亚胺的形成。IEX有两种类型：阳离子交换和阴离子交换层析法。当缓冲液pH值高于此IP时，蛋白带负电（阴离子）；当pH值低于此IP时，蛋白带正电（阳离子）。下面主要介绍离子交换色谱操作中应注意的一些具体问题。
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- xiaoqin2023
- 发布于 2023-10-25 14:38
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xiaoqin2023
安生水
GeneDoc|绘制基因多序列比对图时对序列进行排序
打开GeneDoc软件，输入序列之后，序列顺序是输入文件中序列的顺序。如图： 这种情况下想使序列按照ID进行排序的话，应选择菜单栏中“Sequence List”选项，如图【S】： 在弹出界面选择<Sort...
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- rzx
- 发布于 2023-11-16 14:49
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circos|修改不同染色体之间区块block及连线link的颜色
circos圈图绘制时所有的修改参数都是基于配置文件config.txt。 想要让不同染色体之间区块显示不同颜色。可以修改config.txt中rule参数： <link> #全基因组共线性 bezier_radius=0r...
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- rzx
- 发布于 2023-11-22 11:41
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在Windows系统中安装并使用seqkit工具
seqkit软件介绍： Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。 下载链接：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式： 1. 点...
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- rzx
- 发布于 2024-03-19 17:01
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SNP 过滤标准保证数据质量及参考文献：
最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释，这里总结一下相关的参考文献和标准的出处
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- omicsgene
- 发布于 2024-04-12 16:59
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R语言“had non-zero exit status”安装报错
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- 星莓
- 发布于 2024-03-05 10:53
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微生物与环境因子，代谢物，功能等相关性分析linkET
微生物与环境因子，代谢物，功能等相关性分析linkET
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- omicsgene
- 发布于 2023-12-19 08:20
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微生物多样性扩增子（16S/18S/ITS）课程更新v2.0
微生物多样性扩增子（16S/18S/ITS）课程更新v2.0
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- omicsgene
- 发布于 2023-12-05 13:25
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