在Linux系统中,sed(stream editor)命令是一个非常强大的文本处理工具。它主要用于对文本文件进行过滤和转换操作,支持非交互式的文本编辑。今天,我们就来深入了解一下sed命令的详细使用方法...
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
gdal 报错
shell
Mac | Mac M 芯片应用意外退出问题
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核苷酸多样性(nucleotide diversity),记为π,是分子遗传学中一个重要的概念,可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平,也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...
NCBI下载的单细胞数据只有read1和read2如何读入cellranger
非小细胞肺癌 (GSE139555)
Linux命令处理文件合并
删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy",是什么问题,如何解决
基因组调研图有助于了解即将组装的这个物种的基因组复杂程度,为后续的正式的基因组组装去提供一些依据。基因组的复杂程度可以从基因组大小,倍性,杂合度,重复率等方面去进行评价。 用什么来...
MITE属于II类非自主转座因子,可以使用MITE_Hunter进行检测,MITE_Hunter的运行一共有8步。 1. 报错信息 在运行第六步(-S 6)的时候出现报错: 2. 报错原因 发现第六步执行: 在MITE_...
idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释,其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错: 把三代转录组数据投入PASA是出现报错:unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
蛋白质比对结果快速分类taxid的c脚本
eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包,专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入,以生成一系列图表,可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。
单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中
读 10X的空间转录组数据报错