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核苷酸多样性π的计算

核苷酸多样性（nucleotide diversity），记为π，是分子遗传学中一个重要的概念，可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平，也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...

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Ti Amo
发布于 15小时前
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IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...

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xun
发布于 15小时前
阅读 ( 3 )

R语言基础入门—数据结构（2）

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安生水
发布于 16小时前
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R语言基础入门—数据结构（1）

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安生水
发布于 16小时前
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R语言基础入门—R语言概述与安装！

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安生水
发布于 16小时前
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eQTL分析之协变量计算

准备eQTL分析的协变量文件

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每天学习一点点
发布于 16小时前
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Linux三剑客之grep-文件中的信息捕获

在Linux系统中，grep（Global Regular Expression Print）是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行，并将其打印出来。今天，我们结合以下...

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Ti Amo
发布于 16小时前
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TWAS分析的原理和工具

TWAS（Transcriptome-wide Association Study）是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法，通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析，以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。

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每天学习一点点
发布于 16小时前
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Upset图绘制

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安生水
发布于 17小时前
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exFAT格式的硬盘挂载问题

我们在挂载ntfs格式的硬盘的时候,一般可以正常使用linux命令,不会有啥问题,但是如果硬盘格式是exFAT,会发现有很多问题,比如权限不能改如何判断自己的硬盘的格式?比如位置在/dev/sdb2,用以下代...

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xun
发布于 1天前
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docker clash 配置

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omicsgene
发布于 2024-11-05 11:55
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌（HNSCC）(GSE181919)

数据介绍：来自谷歌翻译：肝细胞癌（HCC）代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里，我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组：原发肿瘤、门...

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omicsgene
发布于 2024-10-31 14:05
阅读 ( 119 )

安装R包报错 fail to lock directory

这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录，这通常是因为之前的安装进程没有正确完成，导致锁文件（一个隐藏的文件，用于防止同时写入目录）仍然存在。

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每天学习一点点
发布于 2024-10-29 17:32
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单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

基因展示图时如何设置细胞排布顺序

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omicsgene
发布于 2024-10-29 09:47
阅读 ( 101 )

HiC-Pro 报错检索解决

报错：运行HiC-Pro的时候出现报错：去看log文件发现：只能知道是在比对的step1就出现了问题。问题查找：此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件，看一...

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Ti Amo
发布于 2024-10-28 15:12
阅读 ( 117 )

R语言绘制多分组差异分析结果图

R语言绘制多分组差异分析结果图加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据

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安生水
发布于 2024-10-25 13:52
阅读 ( 170 )

igraph 报错： libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory

libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory

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omicsgene
发布于 2024-10-24 12:02
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安装R包出现链接库缺失的问题

unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so': libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...