按范围统计数值分布,并用ggplot2绘制饼图;
2018年,《Science》一篇研究论文通过对上百万例实验样品数据进行分析,揭示不同精神疾病之间享有共同的遗传变异,然而神经性疾病表现更为独立。
Excel表包含信息有:期刊全名、简写名、(2018及2017年)中科院分区、影响因子、学科分类、SCI/SCIE、投稿难易程度、审稿周期及期刊主页链接;并通过红、绿两种颜色来区分升级和降级期刊,期刊分区变化一目了然!进来下载!
2018年最新生命科学类SCI影响因子及中科院分区统计
在使用MEGAN软件绘制分类学树状图时,如果物种较少,生成的图片会有大片的黑色区域,很不美观。
正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式,可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...
介绍plantregmap网站的一些分析转录因子的功能
R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题,相关解决方法: 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况(MB) 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...
有时候们会需要基因的启动子序列,这里有脚本可以提取基因组所有基因的启动子序列。
转录因子基本介绍
当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后,会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件!
处理统计RNA-seq 表达量数据,绘制柱状图,PCA散点图,还有不同样品表达基因维恩图。
基于微生物16s测序数据中的OTU丰度矩阵可以进行微生物互作网络构建,从而探索微生物之间的互作关系。而网络的构建方法多种多样,下面给大家推荐一个网站,Microbial association network constr...
差异基因的筛选是基于统计学意义的,不能直观的通过两个数值的大小判断差异基因的是否。 首先:受测序深度的影响,有些样品的测序深度较深,可能导致该样品的readcount数值较高,做差...
聚类分析用于判断差异基因在不同实验条件下的表达模式,将表达模式相同或相近的基因聚集成类,进而识别未知基因的功能或已知基因的未知功能,这些同类基因可能具有相似的功能,共同参...
样品间的相关性反应了样品间的相似程度,即不同处理或组织的样品在表达水平方面的相似度。相关系数越 接近1,样品间的相似度越高,样品间的差异基因也越少。生物学重复间的样品的相关系数...
大数据挖掘解决老年痴呆症的病因,可能更病毒感染有关
GTF文件中class code 注释转录本的类型
R 删除重复数据的方法,包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候,返回逻辑值,以下面的数据框为例: dat A B C D1 a b a c2 c k b d3 c k c c4...
endnote 文献插入出现大括号,不自动更新解决办法