转录因子研究方法!

转录因子研究方法

TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later

TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later 排查

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-20 09:47
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readxl包读取excel的多个函数简介

readxl包括多个可以读取excel的函数,比之xlsx包更方便

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 16:09
  • 阅读 ( 6614 )

下载TCGA基因表达量文件,应该选Count,FPKM还是FPKM-UQ ?

下载TCGA基因表达量文件,应该选Count,FPKM还是FPKM-UQ ?

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-15 14:55
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关于基因家族成员构建进化树时报错如何处理!

有老师在做基因家族分析时,构建进化树时会报错,如何处理?

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  • landy
  • 发布于 2018-06-15 11:31
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rbsurv对生存分析的单因素进行鲁棒性检验

rbsurv对生存分析的单因素进行鲁棒性检验

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-15 11:25
  • 阅读 ( 5561 )

对组装结果中GAP左右批量设计引物

对组装结果中GAP左右批量设计引物

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-15 11:21
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使用GATK call SNP有必要IndelRealigner吗?

使用GATK call SNP有必要IndelRealigner吗?

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-15 11:15
  • 阅读 ( 5011 )

火山图--ggplot2

利用ggplot2进行火山图的绘制

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:59
  • 阅读 ( 6612 )

基因组中的字符都代表什么

参考基因组里除了ACTGN以外,还会看到其他一些字符,看一下这些字符都代表什么?

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-15 09:54
  • 阅读 ( 2624 )

melt函数对数据进行整合

借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理,改变数据组合方式

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:30
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linux下解压命令

在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 17:44
  • 阅读 ( 1928 )

perl处理文件路径

以前处理文件路径的时候都是自己写正则表达式,而用perl的模块来解决则更加迅速、准确。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 15:51
  • 阅读 ( 3132 )

GSEA分析需要的文件及格式

在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候,需要四个文件: 1、基因表达数据文件; 2、表型数据文件; 3、功能基因集文件; 4、芯片注释文件; 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-14 15:11
  • 阅读 ( 21043 )

绘制基因结构图软件GSDS使用过程中图片的修改问题

在使用GSSE绘制基因结构或者是顺势作用元件时,如果图例太多,在网页展示不出来,这个时候你需要对图片进行修改.增大背景画布就可以显示了,点击下图红色箭头所指按钮,进入到图片编辑界面: 拉...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-14 14:48
  • 阅读 ( 11057 )

生存分析的一些基本概念

生存分析的一些基本概念

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-14 10:58
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如何看懂微生物多样性分析当中三元相图ternary

三元相图查看说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-13 13:07
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绘制生存曲线图

生存曲线图的绘制

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-08 18:17
  • 阅读 ( 4165 )

一个预测基因保守结构域网站

今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站: 网址:http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列,点击submit,就开始运行,结果如下图所示: 这个网站不仅分析了蛋白的保...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-08 18:06
  • 阅读 ( 14001 )

从GTF中提取lncRNA的编号和名称

从GTF文件中提取lncRNA对应的ID和名称

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-08 17:28
  • 阅读 ( 6766 )