linux系统当中源码安装R,无root权限安装

1.安装zlib1.2.5版本及以上 cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install 2.安装bzip cd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-02 18:03
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用R做蛋白互作分析

采用R包STRINGdb 来进行蛋白互作网络分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-01 16:49
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igraph 包安装错误

Igraph软件安装错误

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-01 16:12
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Perl读写Excel

生信分析是用的 .xls 文件 大多是文本格式的文件,是可以被Perl读取的,但遇到真的excel文件时,就不行了,这时候就需要使用模块 使用的模块为: Spreadsheet::ParseExcel Spreadsheet::Writ...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:59
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R-对NA 数据进行处理

对数据中存在的NA情况进行处理,替换或者删除

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-01 13:54
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转录组分析基因注释常用的数据库

转录组分析常用数据库

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:42
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linux系统中ls命令的常用用

ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单,如果ls指定其他目录,那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:18
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perl 读取文件中的科学计数数字

Perl读取文件中的科学计数法数字是是以字符串读取的,需要将其转化为小数,方法如下 use Math::BigFloat;my  $i = new Math::BigFloat '1.931533e-01'; 这里用到了Math::BigFloat这个包,就...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:11
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R数据集合并

在进行数据集处理时,经常会合并两个数据集,这里说一下合并数据集常用的2个函数: 合并列:cbind 合并行:rbind 1.cbind cbind使用非常直观简单。当我们需要直接合并2个矩阵或数据框,不需...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:03
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下载TCGA临床信息

采用TCGAbiolinks 去下载TCGA临床数据,并对数据进行整合

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-01 11:57
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挖掘公共基因大数据的时代已经到来

基因大数据挖掘的时代已经到来,您准备好了吗?

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-01 11:25
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GSEA分析需要的基因集Molecular Signatures Database是什么?

在作GSEA的分析时候需要提供一个预先定义好的基因集,用来评估基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势,从而判断其对表型的影响作用,那么基因集都包括哪些呢? GSEA官网的基因集...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-31 16:03
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aggregate对数据分组处理

利用aggregate对数据进行分组处理,包括分组求和,分组取均值,最大值,中位数等等

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-31 15:52
  • 阅读 ( 8752 )

R-常见的字符串处理方法

R语言中常见的基本字符串处理,涉及匹配、替换、分割、截取、大小写转换等等

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-31 14:28
  • 阅读 ( 3052 )

linux 命令当中出现特殊字符无法传递参数怎么办

命令行特殊字符处理方法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-31 11:03
  • 阅读 ( 8457 )

SNP不能转化成CAPS标记?来试试dCAPS吧!

dCAPS是由CAPS标记衍生的分子标记。它是通过引物引入错配的碱基,从而构建或者去除限制性内切酶识别位点的标记技术

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-30 13:41
  • 阅读 ( 19521 )

清华学生是如何度过大学4年的

清华大学电子工程学院学生 洪峰

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-29 15:17
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排序分析PCA、PCoA、CA、NMDS、RDA、CCA等区别与联系

降维排序分析方法包括:PCA、PCOA、CA、DCA、NMDS、RDA、CCA等等还有很多,理解他们的区别与联系才能熟练运用。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-29 13:00
  • 阅读 ( 39724 )

GEO数据库之芯片数据下载

教你利用GEOquery并结合Biobase下载GEO数据库多种数据,轻松数据下载与整理。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:45
  • 阅读 ( 10597 )

read.xlsx读取Excel文件

利用“xlxs"读取真Excel文件中的内容

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:28
  • 阅读 ( 8323 )