由于很多生物学软件都是基于Java开发的,因此想要使用这类软件就必须有Java的运行环境。今天小编就给大家介绍如何在Windows上安装Java。
fasta是常用的序列存储格式,很多软件(如GATK、IGV等)在导入序列以及进行快速查找时通常需要建立索引文件。本文介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。
《Nature》发文证明了某种机器学习算法能够对微生物群落样本进行有效且准确的分类,并且可以找出能够区分组间差异的关键成分(OTU或物种)。本文介绍了该算法的实现形式和应用。
在做微生物多样性分析时,经常会接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn,用它生成的图会更好看哦!
例用Orthomcl查找同源基因,并最终找到单拷贝的直系同源基因。
对于从NCBI大批量的进行数据下载,手动操作无疑是一项沉重的工作,因此可以批量下载数据的方法十分必要。本文介绍如何实现这一方法及后续的一些数据处理方法。
作为常用的正选择分析方法,计算Ka/Ks方法较为严格。本文介绍利用Sites Model方法来分析正选择基因。
这里有大牛施一公亲自指导如何写英文文章。
跟着PNAS学微生物多样性分析!
一本系统详尽讲述植物病毒的书-Plant Virology Protocols(文末有获取方式),堪称病毒学研究里程碑式巨制。主要内容是如何鉴定组装植物病毒!
用测序做基因定位,重测序和简化测序一定会首先映入大家的脑海。有一个我们最熟悉的测序产品反而不那么显眼了,其实转录组也是可以用来做基因定位的,而且效果还不错哦!
以一篇今年发表在《BMC Genomics》上的转录组文章为切入点,探讨18年转录组文章需要怎么写?
环状RNA是什么?有什么用?怎么鉴别?
给大家介绍一类代表包含关系的图,那就是韦恩图。
阅读20000+的已测基因组物种列表更新了,截止于2018年3月最新最全版,建议收藏!
如何筛选显著性差异基因,p value, FDR 如何选
天宫一号虽已坠落,但它曾经为我国农业发展做出过伟大的贡献,我们一起细细数!
向大家介绍一下miRNA靶基因预测,功能研究,定量引物设计等相关的一些网站,值得您收藏。
转录组能与哪些实验相结合来写文章?一个转录组数据如何发两篇文章?答案点进来看!
熊猫吃竹子,貌似天经地义,但是最新的比较基因组学研究证明,国宝吃竹子并非心甘情愿!